獭兔新品系：幼兔成活率达90%以上，成年公兔体重3.5千克，母兔3.3千兔，绒毛长度1.8厘米，细度16 m，密度23000根/c㎡，抢毛率5%以下，背与体侧、体侧与腹部被毛较一致、平整，脚掌毛着生好。推广新品系兔3万只，建立良种扩繁场20个，改良面达80%，出栏优质商品獭兔500万只，开展皮肉加工，新增社会总产值3亿元，社会收益1亿元以上。
课题4 牛新品系选育。
研究目标：培育出肉乳兼用牛和乳肉兼用牛新品系2个，牦牛新品系1个。探索分子生物学技术与数量遗传学技术相结合的育种方法；开展性能测定，建立多性状综合选择指数方法；建立生长速度、肉质及产奶量等性状的分子标记辅助选择。
主要技术经济指标：
肉乳兼用牛新品系：核心群500头，基础群5000头，种公牛50头以上，成年母牛体重450千克，公牛700千克；20月龄肥育体重500千克，育肥期平均日增重1300克；屠宰率58%-60%，净肉率49%，优质肉率40%；产奶量2500-3000千克。
乳肉兼用牛新品系：基础群5000头，种公牛50头以上，群体平均产奶量3800千克，乳脂率4.0%，其中核心群1000头，平均产奶量4200千克，乳脂率4.0%；成年母牛体重480千克，公牛750千克；20月龄肥育体重500千克，屠宰率57%，净肉率47%。
牦牛新品系：基础群4000头，其中核心群600头，种公牛50头以上，群体平均产奶量280千克，乳脂率6.0%，成年母牛体重260千克，公牛300千克；屠宰率50%，净肉率38%。
研究提出兼用牛、牦牛新品系健康养殖配套技术各1套，建立牛育种与改良技术新体系。建立产业化优质高效养殖示范基地6-8个。形成年存栏兼用牛新品系50000头、牦牛10000头，年产奶量10万吨，牛肉10000吨的生产规模；推广新品系牛冻精30万份，年新增社会产值20亿元。
课题5 肉鸡配套系选育。
研究目标：以四川地方鸡种资源为素材，采用分子生物学与数量遗传学技术相结合的手段，在“十五”育成的优质肉鸡新品系基础上开展优质性状的定量化，优质性状的QTL定位与分子标记辅助选择，优质性状基因的纯合与遗传稳定，优质与生产效率的遗传结合等研究，育成突出肉质风味性状的优质肉鸡配套系2-3个。
研究提出优质肉鸡产业链中的安全生产技术，研究适用于四川生产条件的优质肉鸡种鸡及商品鸡的标准化饲养管理技术，在四川省乃至中国西部创建安全、优质、高效的优质肉鸡新产业。
主要技术经济指标：
优质肉鸡父母代：开产周龄23周；开产体重：父系2100克，母系1850克；育成期成活率90%以上；68周龄入舍母鸡产种蛋185枚；产蛋期死淘率6%以下；受精率91%；入孵蛋孵化率80%以上。
优质肉鸡商品代：生长性状：优质I型：90日龄公鸡体重2000克，母鸡1500克。90日龄公鸡料肉比2.5∶1，母鸡2.90∶1。优质II型：70日龄公鸡体重1900克，母鸡1500克。70日龄公鸡料肉比2.45∶1，母鸡2.70∶1。外观性状：羽毛、喙色、胫色、肤色、体形外貌特征一致。肉质性状：肉质鲜嫩、色泽好，肌纤维细、肌内脂肪沉积良好，观感和风味优良，可加工能力强。
年提供父母代鸡苗150万套，推广优质肉鸡1.5亿只以上，产值30亿元，农户获利3亿元，饲养父母代种鸡获利1500万元，每年创造社会效益3.15亿元。
课题6 水禽配套系选育。
研究目标：培育出肉鹅新品系2-3个，形成配套系1-2个，制订肉鹅优质安全生产技术规程和标准1-2套，建立肉鹅产业化优质高效养殖示范区3-4个，建立并示范优质鹅健康养殖技术体系。培育出胴体脂肪较低的肉鸭新品系2-3个，组装成有自主知识产权的瘦肉型肉鸭配套系1-2个及其产业化示范体系。
主要技术经济指标：
肉鹅配套系：培育出优质、高产、抗逆性强的肉鹅新品系2-3个，形成肉鹅配套系1-2个。配套系种鹅产蛋量达100-110个，蛋重140-141克，受精率88-90%；商品肉鹅56日龄活重3.25-3.5公斤，70日龄活重4-4.3公斤。制订肉鹅优质安全生产技术规程和标准1-2套，建立肉鹅产业化优质高效养殖示范区3-4个，商品肉鹅示范规模20000只、种鹅5000只。在省内外推广父母代种鹅20多万只，新增社会产值13.5亿元并取得显著的社会和生态效益。
肉鸭配套系：培育出瘦肉型肉鸭新品系2-3个，形成优质、抗逆、产肉量高的肉鸭配套系1-2个。配套系种鸭年产蛋量260-270个，商品肉鸭7周龄活重3.4-3.5公斤，料肉比2.5-2.6∶1，胸腿率25-26%，皮脂率25%。研制出大型肉鸭健康养殖技术规程和标准1-2套。建立大型肉鸭产业化优质高效养殖示范区2-3个。示范推广瘦肉型肉鸭配套系种鸭26000只、商品肉鸭40000只。在省内外推广瘦肉型肉鸭配套系种鸭10万只，新增社会产值12.8亿元。
课题7 珍稀特有鱼类人工繁育。
研究目标：开展岩原鲤、白甲等长江上游珍稀特有鱼类的人工驯养及苗种繁殖技术研究，取得技术突破2-3项，建立苗种繁育和健康养殖示范基地2-3个。开展无公害标准化养殖、饲料与营养、病害防治、养殖水域环境改良及品种资源可持续利用技术等研究。
主要技术经济指标：
岩原鲤：建立岩原鲤良种场，养殖亲鱼500组，繁殖率达85%，孵化率65%以上，每年提供优质种苗200万尾以上，带动全省养殖商品鱼3500亩，新增产量700吨，新增产值7000万元以上。
白甲：深入开展白甲的繁殖生物学研究，繁殖率达80%，孵化率70%，3年内向全省推广养殖1000亩，新增产量400吨，新增产值2000万元并建立标准化无公害养殖示范基地1个。
研制优质、安全饲料配方2-3个，提出成套健康养殖与疫病防治技术。
课题8 冷水性鱼类人工繁育。
研究目标：利用我省西部地区丰富的冷水资源引进鲑鳟鱼类种质资源，大力发展鲑鳟鱼类人工养殖，建立人工繁育基地，着力解决鲑鳟鱼类苗种供应与配套健康养殖技术问题。
主要技术经济指标：
大西洋鲑与太平洋鲑：亲鱼群各2000尾，后备亲鱼群各10000尾。亲鱼雌鱼相对怀卵量为1500粒/公斤左右，受精率90%以上，稚鱼成活率80%以上，年产大西洋鲑与太平洋鲑鱼苗各400万尾。3龄成年商品大西洋鲑与太平洋鲑体重达到5-7千克，饵料系数控制在1.0以下，达到挪威商品三文鱼优级标准。建立产业化示范基地8个。
五、公共服务方面课题
为充分挖掘我省地方种质资源，评价筛选优良功能基因，建立抗病虫育种公共技术平台，科学、准确地评价农作物区试品种抗性、监测大面积推广品种的抗性变化，为全省大面积品种布局和替换提供依据；提高育种信息服务质量和水平；建立健全区域试验体系，完善区试审定工作，实行区试审定信息网络化；开展突破性品种高产栽培技术的研究，促进传统栽培技术全面升级。选择“主要作物基因资源收集保存、发掘与优异新种质创制”等6个课题。重点开展共性技术研究和育种公共服务能力建设。
课题1 主要作物基因资源收集保存、发掘与优异新种质创制。
研究目标：加强保存基因资源的翻种更新，确保省级中、短期库的正常运转；加大力度收集育种机构的育种中间材料；广泛征集国外育成品种、中间材料及特殊材料。挖掘资源中的高产基因、优质基因、抗病虫基因、抗旱涝（湿）基因、高效利用肥水基因并从分子水平上标记、定位基因，开展基因源的多样性分析；利用远缘杂交、分子标记等生物技术，引入、创新有特殊优异基因的种质和超级作物新材料。
主要技术经济指标：广泛征集国内外特别是国外作物育成品种、中间材料特殊材料、含特殊优异性状或基因的基因资源3500份；翻种更新种质资源3000份；评价鉴定出四川主要粮油作物优异种质200份提供育种单位利用；完善四川主要作物种质资源分发网络，完善种质资源信息服务和反馈体系；利用生物技术挖掘有关高产、优质、抗病虫、抗逆等特殊利用价值基因6-8个并进行分子标记；利用生物技术创新超级作物新材料和作物杂种优势利用新型不育系3-5份，通过省级技术鉴定；申报专利（或品种权）2-3项。
