六、在第十一条“合并”、后增加“分立”。
七、第十二条修改为：“迁建、扩建宗教活动场所，应当经原登记机关同意；其中，迁建、扩建大中城市中的寺观教堂和省级以上风景名胜区中的宗教活动场所，还应当经省人民政府宗教事务部门同意，并依法办理有关手续。”
八、第十三条修改为：“宗教活动场所应当设立管理组织，实行民主管理，建立健全教务、人员、财务、会计、安全、治安、消防、卫生防疫、文物保护等管理制度，接受政府有关部门的指导、监督、检查。”
九、第十四条修改为：“宗教活动场所可以按照宗教习惯接受公民、法人和其他组织自愿捐献的布施、奉献、乜贴和其他捐赠，但不得摊派或者变相摊派。”
十、第十六条修改为：“有关单位和个人在宗教活动场所内改建或者新建建筑物、设立商业服务网点、举办陈列展览、拍摄电影电视片，应当事先征得该宗教活动场所和所在地的县级以上地方人民政府宗教事务部门同意，并依法办理相关手续。”
十一、第十七条修改为：“以宗教活动场所为主要游览内容的风景名胜区，其所在地的县级以上地方人民政府应当协调、处理宗教活动场所与园林、文物、旅游等方面的利益关系，维护宗教活动场所、宗教教职人员和信教公民的合法权益。”
十二、第十九条增加一款，作为第二款：“藏传佛教活佛传承继位和天主教的主教按照国务院《
宗教事务条例》的有关规定办理。”
十三、第二十条增加一款，作为第二款：“宗教教职人员按照国家和省的有关规定自愿参加社会保险。”
十四、第二十四条修改为“信教公民的集体宗教活动，一般应当在依法登记的宗教活动场所内举行，由宗教活动场所或者宗教团体组织，由宗教教职人员或者符合本宗教规定的其他人员主持，按照教义教规进行。”
十五、第二十五条修改为：“举行跨县行政区域宗教活动，须征得所在市（州）宗教事务部门同意；举行跨市（州）行政区域的宗教活动，须征得省政府宗教事务部门同意。举办者应当在拟举行日的30日前向政府宗教事务部门提出申请。宗教事务部门收到申请后，应当对拟举办宗教活动的有关内容进行审查，自收到申请之日起15日内作出批准或者不予批准的决定，并书面告知举办者；对不予批准的决定说明理由。”
