加强基础研究与各类科技计划的衔接。进一步加大应用基础研究资助力度，在数、理、化、天、地、生等研究领域引导科研人员围绕我省经济、社会发展和科技进步的难点问题开展应用基础研究。继续安排青年科技人才专项资金，推动优秀人才的集聚和优势学科及人才梯队的形成。
发展软科学，建立战略研究长效机制。以海峡西岸经济区建设和我省科技、经济社会发展重大战略问题为研究重点，重点研究我省经济、社会、科技协调发展中的战略、规划、政策、体制、管理等决策理论和应用问题，为经济、社会和科技发展重大决策提供科学依据和优化方案，并以软科学研究计划为载体，做好顶层设计，建立战略研究长效机制，促进科技发展，服务经济建设。
五、科技重大专项
围绕全省经济社会发展目标，充分发挥社会主义制度集中力量办大事的优势，在2006～2020年的每一个五年规划中，选准20个左右科技重大专项和基础设施项目，力争取得突破，实现跨越式发展。“十一五”期间实施17个科技重大专项，分别是：
（1）新材料与器件开发及应用
（2）纳米材料与器件开发及应用
（3）环境友好材料开发及应用
（4）信息化集成服务
（5）新一代网络关键技术开发与应用
（6）先进装备与仪器开发
（7）动植物良种培育及关键配套技术研究与示范
（8）农产品保鲜与加工技术研究及应用
（9）工业原料林和花卉产业现代化关键技术
（10）水产健康养殖关键技术研究与示范
（11）新药临床研究与地道药材开发
（12）重大疾病的防治研究
（13）新能源与高效节能技术与产品
（14）清洁生产技术研究开发与应用示范
（15）区域环境保护与循环经济技术研究
（16）区域重大灾害监测与防御技术
（17）一县一业科技富民工程
六、科技发展的保障措施
（一）优化科技创新环境
加强科技政策法规建设。围绕建设创新型省份，制定有利于提高自主创新能力，有利于经济与科技相互协调发展，有利于支撑和引领海峡西岸经济区建设的政策法规。主要包括加大科技投入，激励企业技术创新，促进引进技术消化、吸收和再创新，科技体制改革与区域创新体系建设，加强高新技术产业化，抓好科技人才队伍建设和培养科技领军人才等。
实施技术创新优惠政策。进一步落实国家关于促进企业技术创新、加速科技成果转化等优惠政策，支持企业开发具有自主知识产权的新技术、新产品、新材料、新工艺。鼓励企业对引进技术进行消化、吸收和再创新。政府优先采购具有自主知识产权的高新技术装备、产品。鼓励企业增加科技投入，支持中小企业采取联合出资、共同委托等方式进行合作研究开发，对企业技术创新成果转化给予政策扶持，推动企业成为技术创新主体。
完善知识产权保护制度。强化科研人员和科技管理人员的知识产权意识，提高企事业单位运用知识产权制度的能力和水平。将知识产权管理纳入科技管理的全过程，重点支持以形成重大发明专利为目标的项目，提高我省拥有自主知识产权的数量与质量。加强专利信息的传播和利用，提高科研开发水平。鼓励科技人员以知识和聪明才智贡献于社会，并依法享有知识产权的权益，激发发明创造积极性。加大执法力度，严厉打击侵犯知识产权的违法行为，建立实时高效的预警和应急机制。把形成自主技术标准作为科技计划的重要内容，促使标准与科研、开发、设计、制造相结合，引导产、学、研各方面共同推进重要技术标准的研究与制定。
（二）建立多元化科技投入体制
完善政府投入稳定增长机制。各级政府要依照国家《科技进步法》和《福建省科技进步条例》的要求，在确保财政科技投入法定增长的同时，设立专项资金，加大对科技的支持力度。“十一五”期间，省级财政安排的科学支出和科技三项费用以2005年初财政预算4.2415亿元为基数，继续确保每年递增10%。在此基础上，每年新增科技专项投入2000万元，主要用于省重大科技专项、科技条件平台建设。
建立多元化科技投融资体制。充分利用市场机制和政策调控的作用，鼓励金融资本和知识资本结合，发展科技风险投资事业。设立高新技术创业投资种子基金。通过财政、金融、产业以及收入分配等政策引导，推动企业成为科技投入的主体。引导商业银行提供优质的科技金融产品与服务，建立健全鼓励中小企业技术创新的知识产权信用担保制度，为中小企业技术创新和科技成果产业化创造良好科技融资环境。
