受理人员收到纳税人报送的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及附送资料后，经审核齐全无误的，受理并填开《税务文书领取单》交纳税人，同时将相关资料传递给税收管理员岗位；经审核不齐全或有错误的，退回纳税人，并一次性告知其在规定期限内补齐或改正后重新报送。
（二）初审：主管税务所税收管理岗位收到受理岗位传递的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及附送资料后，按照本通知第四条第（一）款的内容进行审核。经审核无误的签署审核意见，连同附送资料一并报送主管税务所长审核。经审核不符合条件的，在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》上签署意见，连同附送资料一并退回受理岗位。
（三）审核：主管税务所长对税收管理员签署意见的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及有关资料进行复审，经审查符合条件的，在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》上签署意见，连同附送资料一并报送区县级地方税务机关营业税主管部门审核；经审查不符合条件的，退回初审岗位。
（四）复审：区县级营业税主管部门对税务所上报的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及附送资料进行审核，经审查合格的在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》签署意见并上报主管局长批准；经审查不合格的，退回税务所。
（五）审定：主管局长对营业税主管部门上报的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及附送资料进行审核，经批准合格的在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》上签署意见；经审查不合格的，退回营业税主管部门。
营业税主管部门对经主管局长批准合格的自开票纳税人在《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》的年度审验记录上签署意见并加盖区县级税务机关公章。
（六）送达：税务所受理人员收到上一级批复的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及相关资料后，2日内通知纳税人领取已通过年审记录的《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》，同时收回《税务文书领取单》。
（七）时限：主管税务所接到自开票纳税人申报的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》及附送资料后30日内进行审核，签署审核意见后报送区县分局营业税主管部门，区县分局应在30日内作出年审结论。
五、年审结果：
（一）年审合格的处理。
对年审合格的自开票纳税人，主管税务机关在《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》的年度审验记录上签署意见，加盖区县级税务机关公章。
