农业专项资金支持的项目以社会效益和生态效益为主。对以经济效益为主、能带动农民增收的项目，项目申请单位可以是骨干龙头企业、公司和各种农村专业合作经济组织。
第十五条 为保证项目申报文件的真实、科学和完整，项目申请单位应提交可行性研究报告或实施方案。项目申报中，必须要有项目实施内容、建设地点（具体到村）、投资金额、建设工期、资金使用环节、项目实施后的经济或社会效益等内容。
第十六条 州财政局和州级农业主管部门对申报项目进行审核，将符合项目指南要求的项目予以批复下达。
第四章 农业专项资金的使用
第十七条 农业专项资金的使用应实行项目管理。
第十八条 项目单位应根据州财政局和州级农业主管部门批复的项目预算，组织项目实施。
第十九条 项目所在地县级财政部门和农业主管部门应与项目单位的法人代表或负责人签订目标责任书，明确各自的权利和责任。
第二十条 州财政局应及时将批复同意的农业专项资金下达或拨付到项目所在地的县级财政部门。各县应积极推行县级财政报账制管理，纳入财政国库集中支付。州级农业主管部门实施的项目实行州级财政报账制，项目资金实行直接支付。
第二十一条 为规范资金使用，对达到规定标准的农业项目应实行招投标和政府采购制度。
第二十二条 项目单位必须建立健全会计核算制度。
第五章 农业专项资金的绩效管理
第二十三条 对农业专项资金的使用推行项目绩效评价制度，财政部门与农业主管部门对项目实行跟踪问效评价工作。项目竣工后，项目绩效评价结果与竣工验收报告应当一并作为项目绩效评估的依据。
第二十四条 项目实施前，项目所在地农业主管部门应对项目实施内容，建设地点、投资金额及资金来源渠道，建设工期、工程与物资采购方式予以公告，接受社会监督。
