第十条 理事会是工程中心的决策机构，理事会由市科委、依托单位的上级主管部门和依托单位等各方协商产生，理事会主要负责制定理事会章程；审定工程中心的研究开发方向、发展规划、年度计划；聘任及考核中心主任和专家委员会成员；审定工程中心年度经费预算和决算；决策工程中心的有关重大事项。
第十一条 工程中心实行流动、开放、竞争、协作的运行机制。人员实行聘任制或合同制，享有充分的用人自主权。建立聘任、考核、奖惩和与之相适应的分配制度。
第十二条 工程中心的建设资金，采用“企业投入为主，行业扶持，政府资助”的原则。科委资助的资金主要用于购置关键的科研仪器设备、引进必要的专家、技术软件、实验室改造以及人才队伍建设及其它费用等。科委资金必须专款专用，不得用于基本设施建设，并接受科委的监督与管理。投资购置的仪器设备，统一纳入国有资产管理渠道，接受市科委的监督管理。工程中心运行经费主要来源：
1．企业从销售收入中提取的技术开发费用；
2．承接国家、地方研究开发项目所取得经费；
3．通过面向市场，为行业企业提供有偿服务取得的收入；
4．其它收入。
第十三条 工程中心所形成的技术成果、专利、发明等知识产权均为工程中心与投资者共有。也可通过协议方式确定知识产权归属，成果主要完成人可按有关法规持有部分权益。
第十四条 工程中心可以自身技术优势领办或创办企业；或以科技成果为股份投资，其收益必须用于工程中心的发展。
第四章 管理
第十五条 工程中心由市科委负责业务归口管理。工程中心建立工作简报制度，及时反映工程中心建设和运行情况，年末提交年度工作总结并提供有关的统计数据。工程中心的重大事项如重要的学术活动、重大项目立项、主要人事变动等需报市科委备案。
第十六条 市科委负责组织专家及有关部门定期检查和考核、验收工程中心建设计划实施进度。验收后，市科委每两年组织专家考核其运行情况和业绩。运行良好、成绩突出者予以表彰和奖励；管理不善，无科研业绩者，限期改进；连续两次考核不合格者，取消工程中心资格，并酌情收回投资，调出有关的仪器设备。
