有批准权的水行政主管部门应当在受理申请或者收到初审意见后15日内，对占用水域影响评价报告组织专家评审。
第十八条 水行政主管部门审查建设项目占用水域的申请，应当符合下列规定：
（一）受理申请的水行政主管部门应当在受理申请之日起7日内组织进行现场踏勘；
（二）负责初审的水行政主管部门应当在受理申请之日起20日内提出初审意见，并报有审批权的水行政主管部门审查或者批准；
（三）有批准权的水行政主管部门应当在受理申请或者收到初审意见之日起20日内作出是否予以批准的决定；确实难以在规定期限内作出决定的，经本部门主管负责人批准，可以延长10日，并应当将延长期限的情况和理由告知申请人。
依照本办法规定由省人民政府批准的建设项目占用水域申请，其批准程序依照前款第（三）项规定执行。
第十九条 水行政主管部门对建设项目占用水域进行审查时，应当依法组织听证，听取利害关系人和社会公众的意见，论证其合理性和可行性。
第二十条 建设跨河、穿河、穿堤、临河的桥梁、码头、道路、渡口、管道、缆线、取水、排水等工程设施，应当符合防洪标准、岸线规划和其他技术标准，采取相应补救措施，不得危害堤防安全，影响河势稳定，妨碍行洪畅通。占用航道的，还应当符合有关航道管理法律、法规和规章的规定。
第二十一条 建设单位兴建替代水域工程或者采取功能补救措施，应当符合经依法批准的方案。
第二十二条 建设项目临时占用水域的，应当向水行政主管部门提出临时占用水域承诺书，并经水行政主管部门审查同意。临时占用水域承诺书应当载明占用期限、范围、用途、方式、恢复措施及其费用等。
临时占用水域的期限不得超过两年；期限届满确需继续占用的，应当在期限届满前30日内向水行政主管部门重新办理延期手续。临时占用水域只允许延期一次，延期不得超过一年。
临时占用水域期满后，建设单位或者个人必须恢复水域原状。
第二十三条 替代水域工程和功能补救措施，应当经水行政主管部门竣工验收合格。建设单位应当在竣工验收通过后15日内，向水行政主管部门报送有关替代水域工程和功能补救措施的图纸和其他档案资料。
