科研院所是我市科技创新的重要力量。要以健全机制、整合资源为重点，以提升创新能力为目标，进一步深化科研院所管理体制改革。一要切实改变目前科研机构力量分散、创新能力不强的局面，优化资源配置，集中力量形成优势学科领域和研究基地，着力打造重庆市应用技术研究院、农业科学研究院、计量质量检测研究院和科技检测中心等一批重点科技公共服务平台。二要建立稳定支持科研机构创新活动的科技投入机制，引导科研机构建立面向中小企业的科技公共服务平台。三要建立科研院所开放合作的有效机制，促进科研院所与企业和大学之间的联合，促进科技资源共享。
3．完善军民结合、寓军于民的创新机制
进一步探索军民结合促创新的新机制和新模式。一要加强军民结合宏观统筹和协调，建立军民科技管理协调机制、军民两用重大科技项目联合攻关机制。在市级各类计划的安排上，要更多地体现军民结合的发展需求。二要以军民两用技术的研发应用为依托，推动军民技术创新体系科技资源的合理配置、综合集成和高效利用，建立以资源共享为重点的科技创新新机制。三要发挥国防科技的创新优势，引导在渝国防科技力量积极参与地方经济建设，支持地方科技力量承接国防科研和生产任务，加快建立军转民产业化基地。
4．加快三大科技平台建设
科技平台是进行科技活动的物质和信息保障，在科技创新和区域经济发展中具有举足轻重的作用。加快研究开发、资源共享、成果转化三大科技平台建设，建立有效的开放共享机制，增强科技持续发展能力和服务经济社会发展能力，为全社会特别是中小企业科技创新提供公共服务。
加强研究开发平台建设。在优势学科和重点行业领域规划建设一批重点实验室和工程技术研究中心，引导有条件的企业建设一批企业技术中心，力争在国家重点实验室、工程技术研究中心和企业技术中心建设方面取得更大突破。加快博士后流动站和工作站的发展。
加强科技资源共享平台建设。利用现代信息技术手段，通过体制机制创新，跨行业、部门和单位进行科技资源整合，重点建设完善重庆科技信息网和大型科学仪器设备、技术标准、专利、图书文献等科技资源共享数据库，提高科技资源的开放度和有效利用率。
加强成果转化平台建设。重点支持大学科技园建设专业化的科技企业孵化器。加快以重庆生产力促进中心为重点的面向中小企业创新服务的生产力促进中心体系建设。大力发展以创业投资、技术交易等科技中介服务机构，培育以军转民为特色的重庆高交会品牌，引导科技中介机构向专业化、规模化和规范化方向发展。
5．支持高新技术产业基地加快发展
制定有利于高新技术产业发展的政策措施，优化高新技术产业基地发展环境。充分发挥北部新区、高新区、经开区、西永微电子工业园和特色工业园在科技成果转化和高新技术产业聚集发展方面的示范带动作用。重点支持高新区发展科技企业孵化器和创业投资机构，培育一批拥有自主知识产权、具有较强竞争力的高新技术企业，成为带动区域经济结构调整和经济增长方式转变的强大引擎。
6．加强区县（自治县、市）科技工作
区县（自治县、市）科技工作是全市科技工作的重要组成部分，要加强对区县科技工作的指导与支持。一要按照三大经济区的功能定位，实行分类指导。支持主城区和中心城市提升科技创新能力，引导主城区的人才、技术等科技资源向远郊区县流动，加快先进适用技术在渝西地区、三峡库区以及渝东南少数民族地区的推广应用。二要加快建立新型农业技术推广体系。按照“稳定公益性，放活经营性”的思路，进一步激活公益性和经营性农技服务组织的活力，调动广大农技服务人员的积极性，逐步形成功能完善、机制灵活、运转协调、农民信赖的新型农业技术推广体系。三要加快区县科技中介服务体系建设。构建区域性科技企业孵化基地、生产力促进中心、技术转移中心等科技中介服务机构。
7．推进科技管理体制改革
科技管理体制改革的重点是健全科技决策机制，努力消除体制机制性障碍。一要建立市级各类科技计划协调机制，加强部门之间、部门与区县之间、军民之间的统筹协调，提高整合科技资源、组织重大科技活动的能力。二要进一步完善科技评价制度，改进评价指标体系，避免急功近利和短期行为。科技计划要体现经济社会发展需求，重视和鼓励自主创新，把推动产业技术进步作为主要目标。建立和完善科技信用制度，强化过程监管，扩大公开化程度和知情范围。充分发挥科技中介机构在科技评价中的作用。改革科技成果奖励制度，增强政府科技奖励的导向作用，在实行对项目奖励的同时，注重对有突出贡献的科技创新人才的奖励。鼓励和规范社会力量设奖。
（二） 增加科技投入，提高经费使用效益
科技投入是科技持续发展的重要前提和根本保障。直辖以来，我市科技投入不断增长，但与经济社会的快速发展对科技的需求相比，科技投入的总量和强度仍显不足。从增强区域自主创新能力和核心竞争力出发，必须大幅度增加科技投入，为完成本纲要提出的各项重大任务提供必要保障。
建立多元化、多渠道的科技投入体系。充分发挥政府在投入中的引导作用，增强调动全社会科技资源配置的能力。一要加大财政资金的投入力度，形成政府科技投入的稳定增长机制。政府科技投入要按照《
重庆市科学技术投入条例》，确保市级财政科技投入的增长幅度明显高于财政经常性收入的增长幅度，市级科技三项费（不含上级拨款部分）占财政支出的比例应在2%以上。科技三项费应优先向重大科技项目倾斜，保障重大科技项目所需经费投入。政府基础设施建设计划要重点加强对科技基础设施建设的投入。二要通过政策引导，推动企业成为技术创新投入的主体。到2010年，规模以上企业研究开发投入占全社会研究开发投入的比例达到80%以上，2020年提高到85%以上。三要拓宽科技投融资渠道。进一步完善科技创业投资机制和科技创业补偿机制，鼓励发展科技创业投资机构。政府加大对创业投资引导资金的投入，引导和鼓励民间资本进入创业投资领域，提高创业投资的社会化程度。到2010年，全社会研究开发投入占国内生产总值的比例达到1.7%，到2020年达到2.5%以上。
调整和优化投入结构，提高科技经费使用效益。政府财政投入主要用于支持市场机制不能有效解决的应用基础研究、社会公益性研究、重大共性关键技术研究及科技基础条件平台建设等公共科技活动，并引导企业和全社会的科技投入。合理安排各类科技计划经费的比例，建立和完善科技经费管理制度，提高财政资金使用的规范性和有效性。提高科技计划管理的公开性、透明度和公正性，逐步建立财政科技投入的绩效评价体系，建立健全相应的评估和监督管理机制。
（三） 加强科技人才队伍建设，夯实智力支撑
人是生产力中最活跃的因素。科技创新关键在人才。树立“大科技、大开放、大人才”的观念，加强科技人才队伍建设，为自主创新提供人才和智力保障。
加大人才培养力度。以实施“巴渝人才工程”为抓手，重点抓好以“两院”院士、重大科技项目首席专家为核心的高层次科技人才及高水平创新团队的培养；充分发挥高校、科研院所及企事业单位在培养科技人才中的作用；重视中青年科技人才和紧缺人才的培养，努力建设门类齐全、结构合理、素质优良的科技人才队伍。
