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4．以保护三峡水库生态安全为重点的三峡库周绿化带建设
在三峡库区175米库岸线（主要包括长江主干流及嘉陵江、乌江、小江、大宁河的库岸线）至第一层山脊（平均距离600米）范围内建设库周绿化带，全面完成三峡水库重庆库区周边绿化带造林绿化和基本农田建设132.3万亩的任务。坚持因地制宜、适地适树原则，严格按照《三峡水库重庆库区周边绿化带建设工程实施方案》组织实施，并加强抚育管护。
5．以水陆生态界面重建为重点的湿地生态环境保护
坚持“积极保护、科学恢复、合理利用、持续发展”的方针，加强湿地保护的管理，维护湿地生态系统的生态特性和基本功能，减缓人为因素导致的天然湿地数量下降趋势，保证湿地资源的可持续利用。对河流源头和上游区、泄洪区、水土流失严重区、干旱区、珍稀动植物栖息分布区以及对区域生态和气候具有重要影响的湿地严禁开发。
开展全市湿地现状调查及主要天然湿地的生态功能评价。编制全市湿地保护与利用规划以及库区消落区湿地保护规划，制定与湿地保护相联系的水资源管理战略，落实湿地保护措施。建立以小江流域云阳段和开县段消落区人工湿地生态保护区，制定相关的保护方案和措施。
加强库区消落区湿地保护，开展消落区生态绿化建设，以及“消落区生态保护示范工程”建设，开展消落区景观综合整治。
（二）农村小康环保行动工程
结合社会主义新农村建设以及“千村推进百村示范”工程，实施重庆市农村小康环保行动，强化农村环境综合整治，完善环保基础设施，推进农村污染防治，改善村容村貌，提高农村生态环境质量，加快全面建设农村小康社会步伐。到2010年，初步解决农村环境“脏、乱、差”问题，农民生活与生产环境得到保护和初步改善。
1．农村环境综合整治
开展农村环境卫生整治、农村生活垃圾和生活污水处理，改善村容村貌。重点实施100个农村生活垃圾收运-处理系统示范工程，建设垃圾简易填埋场和卫生填埋场；实施农村生活污水处理设施建设示范工程，因地制宜开展农村生活污水处理；实施100个环境卫生综合整治示范工程，开展改水改厕工作，逐步清除简易厕所，并将改厕、改圈纳入当地农村能源建设体系；实施100个村容村貌改造示范工程，开展农村绿化，整治农村污染水体，改善居住条件。
2．高效生态农业建设
深化农业和农村经济结构战略性调整，优化农业区域布局，推广以沼气为纽带的生态农业开发模式、以农田为重点的粮经作物轮作模式和以减少面源污染为核心的农药、化肥、地膜科学使用模式，提高全市旱作农业生产水平，加强传统农业的保护。编制重庆市农业生态园区发展规划，建设生态农业示范园区，提高农村资源利用效率。推广十大生态农业技术与模式，新建240个无公害农产品、绿色食品和有机食品基地。建立农产品生产、加工绿色认证体系，形成布局合理、结构优化、标准完善、管理规范的绿色食品和有机食品体系。
3．小城镇生态环境保护
进一步提高全市城镇化水平，合理规划农村居住点，改善农村居民点过度分散造成的用地粗放、农村基础设施和服务设施相对薄弱的局面，促进区域人口分布和环境承载能力协调。开展重点小城镇环境保护规划编制，落实城镇总体规划中环境保护规划专章，推进小城镇环保规划的实施。加快城镇环境保护基础设施建设，美化城镇景观，完善城镇生态功能，强化监督管理。
4．土壤生态环境保护
开展全市土壤污染现状调查，掌握全市范围土壤污染现状、范围、主要污染物和污染程度；建立土壤污染防治与监测机制，开展土壤污染综合治理示范工程。开展土壤农药、化肥残留动态监控，以及对无公害食品、绿色食品、有机食品种植基地土壤污染状况的监控，重点解决土壤和农产品污染问题。加强主城区近郊农田土壤重金属污染防治，禁止将有毒、有害废物用作肥料或用于造田，严禁危险废物占用耕地。
5．农村面源污染防治
农村能源建设、畜禽养殖和水产养殖污染防治，以及农药、化肥、农膜等面源污染防治具体措施，已经纳入《重庆市“碧水行动”实施方案》。
（三）生物多样性保护工程
坚持“就地保护为主、迁地保护为辅、统筹规划、合理布局”的原则，加强珍稀濒危野生动植物及典型生态系统的保护，落实生物物种资源保护措施，抢救性建立一批自然保护区，建立、健全自然保护区管理体系。
1．生物多样性保护规划
开展全市生物物种资源调查、整理和编目，以及全市自然保护区调查，初步建立全市生物物种资源和自然保护区数据库。划分生物多样性优先保护关键区域，明确不同区域主要保护对象和保护措施。
组织编制全市生物物种资源保护和利用规划，以及全市自然保护区发展规划，纳入全市国民经济和社会发展计划。有关部门结合自身实际，在2007年以前编制完成生物物种资源保护专项规划。编制中国-欧盟生物多样性保护项目建议书。
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