1、发挥知识人力资本主导作用。全面落实“科技是第一生产力”、“人才是第一资源”的思想，充分发挥和释放知识资本以及人力资本的潜在能量，使之成为创造高附加价值的核心生产要素，并在资源配置过程中占据主导地位，为上海知识竞争力的提升创造先决条件。
2、持续增强科技自主创新能力。通过完善和优化科技创新体系，提供适宜的制度安排和创新环境，在若干优势领域内，聚焦有限目标，进一步夯实上海原始创新能力、集成创新能力、引进消化吸收再创新能力的基础，持续增强上海科技自主创新能力，逐步提高上海知识生产、知识应用、知识转移的层次和效率。
3、支撑引领经济社会协调发展。服务经济社会发展是科技发展和知识竞争力提升的目标与归宿。科技创新既要为提高经济增长的速度和质量作出贡献，又要为人口、资源、环境等社会问题的解决提供出路，支撑经济社会全面、协调、可持续发展。科技创新要在满足经济增长和社会进步提出的现实需求基础上，更加着眼未来知识社会发展的潜在需求，不断拓展新的空间，引领经济社会发展进入更高的层次。
（二）战略目标
根据世界发展趋势以及国家科技发展战略，结合上海科技、经济和社会发展实际，提出以知识竞争力为测度的上海区域创新体系建设和科技发展的目标。
1、战略目标（2020年）：知识竞争力充分提升，知识社会形态初现。区域创新体系高效运转，知识竞争力名列亚洲前列并进入世界先进地区第二集团，成为亚太地区的研发中心之一。若干科技领域达到世界领先水平，涌现出一批具有自主知识产权和国际竞争力的产品和产业，全社会研究开发（R&D）经费支出相当于地区生产总值的比重达3.5%以上（其中企业R&D经费支出占全社会R&D经费支出的比重达到70%左右），万人R&D人员全时当量达60人年/万人，公众科技素养达标率超过15%，国际科技论文年收录数量达40000篇，百万人年专利授权数量达3000件（其中百万人年发明专利授权数量达450件），知识密集产业的增加值占地区生产总值的比重达到40%以上，为上海基本建成经济、金融、贸易、航运中心和现代化国际大都市提供强有力的支撑与保障，为我国成为科技强国奠定基础并发挥引领作用。
2、阶段目标（2010年）：知识竞争力加速提升，知识社会基础夯实。区域创新体系逐步完善，知识竞争力居全国前列，全社会R&D经费支出相当于地区生产总值的比重达2.8%以上（其中企业R&D经费支出占全社会R&D经费支出的比重达到65%以上），万人R&D人员全时当量达45人年/万人，公众科技素养达标率超过10%，国际科技论文年收录数量达25000篇，百万人年专利授权数量达1500件（其中百万人年发明专利授权数量达200件），知识密集产业的增加值占地区生产总值的比重达到30%以上，科技创新成果为上海世博会提供技术支撑，上海成为国家重要的知识生产中心、知识服务中心和高新技术产业化基地，在夯实创新型国家建设基础的过程中发挥重要作用。
（三）基本思路
根据上海科技发展的总体目标，提出“以应用为导向的自主创新”竞争策略，并以此为基点，明确上海中长期科技发展的基本思路：定位上，在确保一定的科学发现作为必要的战略储备的前提下，重点关注技术创新的效率和效益。路径上，在若干优势领域内聚焦有限目标，通过开展原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新，持续增强上海自主创新能力。抓手上，将战略产品研发、示范工程建设作为上海科技创新的两个重要突破口，前者以商业价值实现为重心，形成自主知识产权的战略产品并带动具有国际竞争优势的产业发展；后者以社会价值实现为重心，建成在我国全面建设小康社会过程中具有推广价值的工程示范。载体上，将企业作为技术创新的主体，战略产品必须由企业提出并作为主要执行单位，由企业组织高校、科研院所的力量开展联合攻关。
三、上海中长期技术创新的主要任务
贯彻以应用为导向的自主创新竞争策略，按照科技发展的趋势，围绕新兴产业的培育和传统产业的提升，面向上海在健康社会、生态环境、高端制造和智能城市方面的战略需求，将构筑“健康（Healthy）、生态（Ecological）、精品（Advanced manufacturing）和数字（Digital）上海”的“引领工程”（HEAD）作为上海中长期技术创新的主要任务，围绕11个应用方向，研发33个战略产品或功能，攻克相关的60项关键技术。
（一）健康上海--营造身心健康、安全和谐的生活
坚持以人为本的发展理念，满足人口老龄化、居住高密度、交往多流动、工作快节奏、体力低消耗等带来的健康需求，整合生命科学、医学和药学的综合科技优势，以“早”（早预防、早发现、早治疗）、“快”（快检测、快诊断、快康复）、“低”（低创伤、低毒副、低价格）以及“个性化”等特点和功能为方向，围绕公共卫生与防疫、疾病诊断与治疗、重大新药创制等3个应用方向，重点支持开发7项战略产品或功能，攻克17项关键技术，带动相关技术和产业的发展，使上海疾病预防、诊断、治疗和新药开发的技术总体水平和综合实力居国内领先地位，并具备技术扩散、产业扩散和服务扩散的能力，成为亚洲生命健康科技和产业的重镇。
1、公共卫生与防疫
以防治结合、重在预防为指导方针，构建覆盖面广的公共卫生与防疫科技支撑体系，开展重大传染病传染源及食源性疾病病因、流行趋势、波及范围分析，在重大公共卫生突发事件处理、食品安全与检测、生物安全和防恐等领域突破关键技术，形成重点产品。
（1）重大呼吸系统传染病预防及疫苗
研制可快速诊断、发现呼吸道传染病病原体及耐药等生物学特性的技术和产品；开发流感、流脑、禽流感及结核病等预防用疫苗；建立针对呼吸道传染病特点的早期发现、隔离和接种疫苗的社会化技术预警体系。
（2）食品安全与生物安全保障
建立跨部门的食品中关键污染物监测点与网络、预警和食品污染应急处理技术体系，建成上海主要食品中化学污染物检测基本数据库；建立生物污染快速检测及预警系统技术与标准体系；食品安全和生物污染的监测预警、检验鉴定、防治疫苗与药物、污染消除、应急处置等技术和装备跨入国际先进行列。
2、疾病诊断与治疗
通过对心脑血管病、糖尿病和恶性肿瘤的防治研究，在预防和治疗两方面集中攻关，形成一批具有明显应用价值、适合心脑血管病和恶性肿瘤防治迫切需求的防治手段和规范，为重大疾病的早期预防、早期诊断和早期治疗提供新技术、新装备和新途径。
（3）心脑血管病、糖尿病和恶性肿瘤三大疾病诊疗
开展心脑血管病、糖尿病和恶性肿瘤高危人群早诊技术及规范化治疗研究，完善高危人群综合干预和优化筛检方案，使三大疾病得到有效控制，显著提高治愈率，降低死亡率。
（4）智能医疗装备
研制用于诊断和治疗的临床数字医学影像产品和信息系统；开展全自动酶免生化分析系统、核磁共振超声消融系统、医用回旋加速器中的质子束治疗系统、全身正电子发射体层像扫描系统等关键技术研究，进行样机试验和临床验证，实现诊断治疗智能复合设备的商品化生产。
（5）先进生物医用材料
研发用于诊断、治疗、修复或替换病损组织、器官或增进其功能的新材料，促进组织修复、人工器官替换、药物传递取得应用。人工皮肤、人工软骨、人工神经、人工肝等进入临床应用；纳米技术应用于药物控释材料及基因治疗载体材料取得重大进展；复合生物材料得到大规模临床应用。
3、重大新药创制
探索药物研发新途径，开辟疾病治疗新领域，促进上海医药产业由仿制为主向创新为主、由生产主导型向研发主导型的根本性转变。开发具有自主知识产权的生物、化学技术创新药物，并争取进入国际医药市场；构筑上海中药研发体系，突破中药现代化关键技术，培育具有自主知识产权的中药拳头产品。
（6）基于中药的创新药物
开展中药及天然产物活性成分（群）分离纯化与制备等研究，发现新先导化合物和候选药物；开展基于新策略和新靶标的先导化合物的结构改造与优化研究；推进基于中药先导化合物的、拥有自主知识产权的创新药物通过新药临床研究，实现中医药传承和创新发展。
（7）转染色体动物的构建与应用
