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区县人民政府设立相应的动物疫情应急指挥部及办公室。指挥部领导本区县重大动物疫情的控制和扑灭等工作，决策有关重大事项；办公室负责《预案》的具体实施。
（二）部门职责
1．农业部门。
（1）做好疫情的监测、报告，开展流行病学调查，诊断疫病，迅速对疫情等相关情况做出全面分析，并制定疫情控制和扑灭的技术方案。
（2）调集动物防疫和动物防疫监督人员参加疫情的控制和扑灭工作。
（3）划定疫点、疫区、受威胁区，提出封锁建议，并参与组织实施。
（4）监督、指导疫点内畜禽的扑杀、畜禽尸体和畜禽产品的无害化处理工作；疫点、疫区内污染物等实施消毒和无害化处理；饲养场所及周围环境的严格消毒。
（5）组织对疫区、受威胁区易感畜禽实施紧急免疫接种。
（6）对疫区、受威胁区内的易感畜禽的饲养和经营，及畜禽产品的生产、贮藏、运输、销售等活动进行监测、检疫和监督
管理。
（7）建立紧急防疫物资储备库，储备足够的疫苗、药品、诊断试剂、器械、防护用品、交通及通讯工具等。
（8）对封锁、扑杀病畜禽和同群畜禽、无害化处理病（死）畜禽和同群畜禽（包括污染物）、消毒、免疫接种等所需费用及补贴所需资金做出评估，并安排资金使用计划。
（9）培训兽医专业技术人员及其他有关人员，建立疫情处理预备队。
（10）参与组织对疫点、疫区及其周围群众的宣传工作。
2．财政部门：负责筹集、划拨紧急防疫储备金。会同农业部门制定资金使用计划和管理办法，负责监督储备金的使用。
3．计划部门：负责紧急防疫物资储备、调运等基础设施建设的计划安排。
4．交通、铁路部门：负责优先运送控制扑灭疫情人员、物资、药品和器械，配合畜牧兽医部门做好动物防疫监督检查站设置及疫区封锁工作。
5．出入境检验检疫部门：负责出入境畜禽类及其产品的检疫工作，并及时向当地重大动物疫情应急指挥部办公室通报有关情况。
6．公安、武警部门：参与做好疫区封锁、疫点内畜禽的扑杀，加强疫区社会治安管理和安全保卫工作。
7．工商部门：根据对疫区封锁情况，关闭疫区内畜禽及其产品交易市场。
8．卫生部门：负责疫区内人员的预防和疫病监测工作。
9．军队、司法等部门：按照当地重大动物疫情应急指挥部的统一部署，配合畜牧兽医部门，做好紧急疫情处理工作。
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