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1、农业部门
（1）具体协调、指导有关部门和单位参加疫情控制扑灭工作；
（2）对疫情做出全面分析，并制定疫情控制扑灭技术方案；
（3）划定疫点、疫区、受威胁区，提出封锁建议并参与实施；
（4）监督、指导疫区禽类扑杀、禽类尸体、排泄物和禽类产品、副产品无害化处理，对污染物实施消毒和无害化处理，对饲养场所及周围环境进行消毒等工作；
（5）负责现场诊断、疫情监测、流行病学调查、疫源追踪等工作；
（6）统一供应和发放国家指定单位生产的高致病性禽流感疫苗，监督指导受威胁区禽类紧急免疫接种；
（7）对受威胁区易感禽类生产经营，以及禽类产品生产、储藏、运输、销售等活动进行监测、检疫和监督；
（8）建立突发疫情应急处置物资储备库，储备足够的疫苗、消毒药品、消毒器械、诊断试剂、防护用品等疫情应急处置物资；
（9）建立突发疫情应急预备队，培训兽医专业技术人员及其它有关人员；
（10）对封锁、扑杀病禽和同群禽，无害化处理病（死）禽和同群禽（包括污染物），消毒、紧急免疫接种等所需经费及补贴所需资金作出评估，并提出资金使用计划；
（11）加强场地检疫（到场检疫）和屠宰检疫（驻场检疫），加大对动物场地、屠宰环节、市场环节、流通环节的监督、加查力度，确保防控计划顺利实施。
2、其它部门
市政府办公厅：在防控高致病性禽流感期间，负责各部门之间的协调沟通。
新闻宣传部门：加强对各种媒体的管理，对国外发生高致病性禽流感情况的报道要坚持正确的舆论导向；国内发生高致病性禽流感疫情由农业部统一对外公布，各种媒体不得擅自公开报道。
计划部门：根据本预案，做好有关动物防疫、动物检疫和兽医卫生执法监督基础设施建设。
财政部门：保证禽类疫病防控所需的疫苗、扑杀、检测、消毒药品、防疫器材、突发应急疫情物资储备、扑杀病禽补偿和动物防疫工作经费的落实。
卫生部门：监测和防控禽流感向人群传播。发生疫情时，派出医学人员到疫情现场对接触病（死）禽的人员进行监测，对确诊病人进行救治，对疫区和受威胁区村镇道路、公共场所进行消毒，广泛宣传防止人感染禽流感知识。
林业部门：搞好鸟类监测工作。
公安部门：协助做好疫区封锁和强制扑杀、强制免疫工作，做好疫区安全保卫和社会治安管理工作，配合搞好临时动物检查消毒站工作。
纠风部门：协助畜牧兽医行政管理部门在封锁区设立临时性动物检疫消毒站，搞好督查工作。
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