第四十四条 各级地方税务机关对自开票纳税人提交的相关电子数据进行汇总时，必须严格执行以下规定，以确保内部系统的安全：
（一）采集、汇总数据用机必须按市局统一要求安装杀毒软件，防止外来存储媒介或电子邮件携带病毒对本机及本局造成影响。
（二）专人负责，定期对采集、汇总数据用机上的数据进行备份，以免发生数据丢失，影响工作。
第六章 异常发票审核
第四十五条 稽核比对中发现异常的货物运输业发票的错误类型：一类是技术性错误，如录入错误、已申报但漏采集、漏传递、错报为失控或作废发票等；二类是涉及发票的一般性违规行为，需要进行补税、加收滞纳金和罚款但不需要立案查处；三类是涉嫌偷骗税，需要立案查处。
第四十六条 异常发票审核各部门基本职责和工作流程：
（一）开票方主管地方税务机关稽查部门（以下称“稽查管理部门”）负责接收抵扣方主管国家税务机关稽查部门关于货物运输业发票的协查函，接收后3日内负责分送给各开票方主管税务所进一步核实；
（二）各开票方主管税务所负责对异常发票信息进行检查，可采取下户检查方式进行核查。如属于第一、二类问题的，每月5日前向区县级地方税务机关营业税主管部门报送《货物运输发票审核检查情况汇总统计表》（HY17）、《货物运输发票审核检查结果统计表》（HY18），以及异常发票问题情况说明。对属于第三类异常发票问题，填写《发票审核检查移交清单》（HY19）移交纳税评估部门。
（三）稽查管理部门负责对税务所移送的属于第三类问题的货物运输业发票，按《
税务稽查工作规程》的规定进行处理。
稽查管理部门对移送的第三类问题应单独登记台帐。每月5日前将《货物运输发票审核检查情况汇总统计表》、《货物运输发票审核检查结果统计表》，以及异常发票问题情况说明反馈区县级地方税务机关营业税主管部门；并于每月10日前将第三类问题的处理结果和相关情况分析上报市局检查处。
（四）区县级地方税务机关营业税主管部门负责汇总各开票方主管税务所的第一、二类问题和稽查管理部门反馈的第三类问题，填写《货物运输发票审核检查情况汇总统计表》、《货物运输发票审核检查结果统计表》，以及异常发票问题情况说明，每月10日前报送市局营业税管理处；营业税管理处每月14日前上报国家税务总局。
（五）稽查管理部门负责将审核检查结果统一反馈给抵扣方主管国家税务机关稽查部门。
第四十七条 异常发票审核检查方法。
（一）如果不属于存根联采集录入等技术性错误，将结果反馈抵扣方主管国家税务机关。
（二）如果属于存根联采集录入等技术性错误的货物运输业发票，进行修改后经人工比对两联相符的，或进行修改后两联仍不符的，将信息反馈抵扣方主管国家税务机关。
（三）对由于开票方原因造成比对异常的，由开票方主管地方税务机关管理部门按照《
国家税务总局关于增值税专用发票和其他抵扣凭证审核检查有关问题的通知》（国税发[2004]119号）文件规定的不同情况依有关规定分别进行处理。
