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优先主题：
6．汽车摩托车
重点加强轿车自主设计开发平台建设，研究代用燃料汽车和混合动力汽车整车设计、制造关键技术，大排量节能、环保摩托车整车开发技术，汽车摩托车关键零部件设计、制造与检测技术，汽车电子技术与关键电器元件设计开发技术，节能、环保汽车摩托车发动机设计制造技术，汽车摩托车安全性、舒适性技术。
7．重大成套装备及其基础件和通用部件
重点研究开发数控机床、精密专用数控设备、发输变电设备、风力发电成套装置、中小型特种船舶和环境保护装备等重大装备的关键技术，重要基础件和通用部件的设计、制造和大规模生产的关键技术，基于工业以太网的仪器仪表关键技术，基于新一代现场协议与标准的控制系统，特种传感器和变送技术，轨道交通设备、港口设备、工程机械及大型结构件关键技术，精密成型、快速成型等先进基础加工工艺技术。开发数控化、模块化、智能化、集成化产品。
8．数字化设计与集成制造
重点研究设计与制造集成技术，数字化设计、制造与执行系统，建立面向产品的数字化、网络化、智能化设计平台和制造平台，开展制造设计与制造执行集成技术应用示范工程。
9．新材料制备与应用
重点研究开发高性能结构材料、新一代功能材料和器件、新型建筑材料、新型高分子材料、新型润滑材料及燃料、先进复合材料及纳米材料的设计、制备与应用技术。
（三）信息产业及现代服务业
发展信息产业和现代服务业是推进新型工业化的关键。我市在信息化基础设施、信息技术应用和现代服务业发展等方面具有一定的基础。但是，信息产业缺乏核心技术和关键产品，信息资源开发不足、共享程度低，现代服务业信息化程度不高、附加值低。
发展思路：以需求为导向，加强应用软件、通信技术与设备开发，加强新一代网络基础设施建设和信息资源整合，加快信息技术在现代服务业中的推广应用，加速国民经济和社会信息化进程。
优先主题：
10．集成电路与光电集成技术
重点研究基于深亚微米工艺的集成电路设计方法学与设计工具，数模混合电路设计技术与设计工具，专用集成电路设计与工艺，系统级集成电路设计平台与集成电路模块重用技术，高密度集成电路封装工艺，系统级集成电路关键测试技术，光电集成电路的自动化设计技术，微系统与集成芯片技术。
11．微电子机械系统技术
重点研究微机电系统（MEMS）器件及系统一体化设计、测试和加工等共性关键技术，建立MEMS设计开发平台，开发MEMS器件及系统等。
12．数字电子产品与网络信息家电
重点研究开发数字移动通信与宽带无线接入产品，数字电视与多功能数字用户终端，数字相机，高密度数字光盘产品，数字音视频广播系统设备，数字化办公设备，数字娱乐电子产品，家用信息网络平台，计算机、通信和消费家电相互结合的网络信息家电。
13．下一代网络与通信技术
重点研究基于IPv6/IPv4的下一代网络终端技术，未来宽带移动通信无线接入及传输的基础理论与核心技术，动态灵活光网络的体系结构及关键技术，下一代网络管理与安全技术，现有网络与下一代网络的互连、融合和下一代网络新业务。
14．现代服务业信息支撑技术及应用软件
重点研发现代物流、电子商务、电子政务等现代服务业领域发展所需的高可信软件体系技术、嵌入式软件技术、软件中间件技术、企业信息化等应用软件核心技术，游戏软件核心技术。
15．智能信息处理与信息安全
重点研发大规模知识获取、处理和管理的理论与技术，基于自然语言理解的中文信息处理技术，可视化与智能化人机接口技术，知识和智能技术，图像智能识别技术，高效密码的分析与设计技术，信息隐藏理论与方法。
（四）人口与健康
提高人口质量，有效防治重大疾病、常见病与地方病是建设和谐社会的必然要求。我市人口基数大，新生儿出生缺陷发生率高，老年人的健康问题日益突出。三峡库区环境变化对保障广大群众生命健康安全提出了更高要求。
发展思路：重点发展生殖健康关键技术，加强重大疾病、常见病和地方病的诊断和防治关键技术研究，加强三峡库区环境污染对健康的影响及其防治技术研究，加强中医药传承与创新，加强新药、新型数字医疗设备、医用材料制备关键技术的研究开发。
优先主题：
16．人口安全与重大疾病
重点研究开发安全、有效避孕节育新技术和新产品，高效无创出生缺陷早期筛查、检测及诊断技术，人工辅助生殖技术，遗传性疾病安全有效生物治疗技术，艾滋病、肝炎、流行性感冒等重大传染性疾病和心脑血管疾病、肿瘤等重大非传染性疾病预防和诊疗技术，防止突发疫情关键技术，群发性食品中毒、危险化学品和放射性伤害紧急救治，城乡社区常见病、多发病和地方病的监测与诊疗技术，对水环境污染伤害的监控与防治技术。
17．重大新药创制
重点研究自主创新药，新化学和生物药设计，生物制药制备发酵工艺，新化学药合成工艺，药物新剂型及新型给药系统。
18．中药现代化
建设中药材规范化种植基地，重点研究中药产业化关键技术，道地药材资源的保护与开发利用，青蒿、黄连等优势药材产业链的培育和壮大，中药大品种的二次开发，中药新药研发，现代中药生产与质量控制等技术。
19．新型医疗设备与生物医用材料
重点研究新型治疗器械和常规诊疗设备，数字化医疗技术及设备，小型诊疗和移动式医疗服务装备，远程诊疗控制技术及系统，组织工程技术、人体组织器官替代技术及产品，新型医用材料。
（五）环境保护
生态平衡与环境保护是事关经济社会可持续发展和人民生活质量提高的重大问题。我市水环境质量不容乐观，次级河流富营养化现象加重，面源污染形势严峻，城区空气综合污染指数较高，生态环境恶化的趋势仍未得到有效控制。环境污染已经成为经济社会持续健康发展的制约瓶颈。
发展思路：强化生态平衡的调查研究，加强环境保护技术集成创新，开发清洁生产技术，废弃物资源化利用和安全处置技术，实施区域环境综合治理，改善环境质量。
优先主题：
20．环境污染综合防治与生态修复
重点研究三峡库区流域性、区域性复合污染过程机制与污染防治，三峡库区及库岸区域环境污染控制与生态修复，大气污染控制，城市生态环境及人居环境改善，工业污染控制，农业面源污染控制技术。
21．废弃物循环利用
重点研究再生资源回收利用，城市生活垃圾、矿山固体废弃物、大宗工业废弃物资源化利用，农业废弃物资源化处理技术。
22．环境污染与人体健康
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