（二）土地权利人不按规定时限到国土资源局办理土地证书查验手续的，国土资源局可责令限期补办，逾期仍不补办的，其所持的土地证书无效。
（三）土地权利人持上述无效土地证书或未办理土地证书查验手续、土地证书查验不合格的，国土资源局对其土地使用权转让、出租、抵押以及企业改制、改变用途、商品房屋出售、房改房过户等交易行为，不得办理有关用地审批等手续，建设、规划、房屋等管理部门也不得再以此证书办理相关手续。
（四）土地使用权转让未办理变更土地登记手续的，国土资源局应依据国家土地管理法律、法规进行处理：
1.法律规定土地使用权不得转让的，其土地使用权转让无效；
2.法律规定土地使用权可以转让，但未办理有关用地手续的，土地权利人必须先经依法处理，并补办有关用地审批手续，按规定补交出让金等土地收益后，方可办理变更土地登记手续；
3.法律规定土地使用权可以转让并已办理有关用地审批手续的，可直接给予办理变更土地登记手续。
对经查验确认依法转让土地使用权应缴纳税费的，应通知其办理费税缴纳手续。
（五）土地权利人擅自改变土地用途或者不按规定进行土地使用权出租、抵押的，经依法查处，并完备有关法律手续后，方可给予办理土地登记手续。涉及补办用地审批，补缴土地出让金等土地收益的，要按规定补缴。
（六）在土地证书查验期间，对2005年7月1日后按规定已办理或正在办理中的变更土地登记，不进行土地证书查验。但应将土地登记的情况直接填写在《土地证书查验工作表》的“土地登记情况”栏内，以便统计、汇总。
（七）对尚未到国土资源局进行初始土地登记的土地使用者，应持有关证件，按《
土地登记规则》的有关规定申请土地登记、办理土地证书。国土资源局应单独填写《土地证书查验工作表》，单独汇总。
（八）对土地证书查验中发现有土地证书错登、漏登的，国土资源局应进行更正登记，更换土地证书。
（九）土地证书查验中发现土地使用权变更未及时进行地籍数据变更的，国土资源局要组织有关人员对地籍图和地籍数据库进行修测、补测和完善，以保持地籍数据的现势性。
对尚未进行地籍调查的地区，国土资源局要利用各种资料或组织专业人员进行地籍数据的完善，以保证查验工作不重不漏。
