七、环境保护部门或上级主管部门责令限期治理后，经会同检查，无特殊原因逾期不治理或未完成治理项目，除处以罚款外，还应加倍收费。
八、凡被加倍收费的单位，除按规定缴纳的那部分排污费可从企业生产成本或单位事业费中列支外，其余加倍收费部分，企业分别从税后留利、利润留成或企业基金中列支；事业单位在预算包干结余中列支。
九、对个人的罚款，其所在单位接到区、县环境部门发出的《罚款通知》后，由单位财务部门从其工资中扣除，连同对单位的罚款一并在限期内向指定银行缴付。
十、第一、第三类废气收费计算方法，以排出口的超标浓度、风机的实际风量和开班时间或实际排放时间连乘的积数为排污量；第二类废气如排出口的浓度超标，则按烟气总量计算收费。敞开式生产排放的，以物料平衡计算排污量，然后根据不同收费标准计算缴费金额。
十一、蒸汽锅炉、工业炉窑、营业灶等，无消烟除尘设施或配套不齐的，一般烟尘都超过排放标准，均须按《办法》收费标准缴费，对于消烟除尘设备齐全的炉、窑用重量法测试。超过标准的，根据测试浓度缴费(见附件3)。以油为燃料的炉、窑、灶可用林格曼图目测，黑烟浓度超过林格曼对比图一级的，按燃油量计算缴费金额。凡超标的炉、窑、灶都复无起征排污费基数。
十二、炉、窑以焦炭、废弃物为燃料(严禁在居民集中区使用沥青、油毛毡及有害的化工原料下脚。在非居民集中区焚烧上述废弃物，按耗用总量计算，每吨缴排污费10元)排放烟尘超过标准的，根据2：1的比例折合用煤量计算缴费(即每两吨焦炭、废弃物换算为一吨煤)。
10吨/小时以下的化铁炉，凡排放烟尘超过标准的，按其超标准 尘量计算缴费。每超标一公斤缴费壹角。
十三、废渣的计算，以废渣的比重与堆放的体积相乘即废渣重量，然后，根据不同收费标准计算缴费金额。
十四、废水收费计算：第一类废水经过处理后，五日生化需氧量已达到排放标准，但因技术上原因，化学耗氧量尚达不到标准 可暂不缴费；未经处理或虽经过处理的废水五日生化需氧量与化学耗氧量均未达到排放标准，则按其中超樯倍数高的一项计算缴费；悬浮物、色度、酸碱度三项指标，按其中超标倍数最高的一项计算缴费。其余第二、三类废水中如含有多种有毒有害物质，应按其超标情况分别计算，逐项累计。
