一、提高认识，切实加强对爱国卫生工作的领导。爱国卫生运动是具有中国特色的社会卫生工作方式，是社会主义精神文明建设的重要组成部分，是推动经济和社会发展的重要事业。尤其在当前我区经济、社会发展相对落后，社会卫生工作相对滞后，群众卫生素质差、法制观念淡薄的情况下，爱国卫生运动是一项必须长期坚持的重要社会系统工程。因此，各地区、各部门，尤其是各级领导，要从经济社会发展的全局高度，进一步提高对爱国卫生运动重要性的认识，把爱国卫生工作作为各级政府的重要职责，把爱国卫生工作纳入当地国民经济和社会发展规划，保证人力、物力、财力的基本投入，切实加强领导，加大工作力度，实行领导干部爱国卫生工作实绩考核制度。要正确处理好“市容与繁荣”、“健康与小康”的辩证关系，妥善处理好安置下岗职工和环境整治的关系，坚持两个文明一起抓。各级政府每年都要召开一两次会议，专门研究爱国卫生工作，及时解决社会卫生方面存在的突出问题，集中力量办几件实事、好事，推动爱国卫生工作的全面开展，使全区爱国卫生这一重要的社会事业与全区经济建设得到同步、协调发展。
二、进一步明确地位和作用，完善爱国卫生工作的机构。全区各级爱卫会是各级政府的非常设机构，负责本行政区域内爱国卫生运动的统一领导和统筹协调。它的主要职责是负责组织贯彻国家的爱国卫生工作方针、政策和措施，拟定和组织实施地方爱国卫生工作方针、政策和措施，统筹协调各有关部门和社会团体，制定和开展防治疾病、重大疫情、中毒事故的防范措施和应急对策，组织实施消灭蚊子、苍蝇、老鼠、蟑螂等病媒生物的工作，动员全社会参加爱国卫生运动，广泛进行健康教育，组织开展创建卫生先进地区和单位活动，负责农村牧区改水、改厕、环境卫生治理的检查督促工作。
各级爱卫会办公室是同级爱卫会的办事机构，担负着爱国卫生运动日常工作。各有关部门要积极支持爱国卫生工作，尽可能为爱国卫生工作创造良好社会环境。
三、当前和今后相当长的时期内，全区爱国卫生运动总的目标是：要以推动全区经济发展和社会进步为目标，以改善人民群众生存卫生条件为重点，广泛深入地开展爱国卫生运动。1999年至2000年要使全区爱国卫生运动组织机构网络进一步完善，建立起与社会主义市场经济相适应、保证各项工作有效运行的爱国卫生运动运行机制，使城乡爱国卫生运动法制化、制度化、规范化建设得到明显加强，城乡卫生面貌得到显著改善。到2010年，努力使全区爱国卫生运动与经济、社会协调发展，城乡总体卫生水平明显提高，全区相当数量的城市成为卫生城市，农牧区以改水改厕为重点的环境卫生状况有明显改善，苏木乡镇所在地居民全部饮用自来水，农牧民基本饮用安全卫生水，有效地控制“四害”传播的疾病，群众卫生素质普遍提高。围绕这一总的目标，当前全区爱国卫生工作的具体任务是：
