根据自治区人民政府的规定，管理自治区测绘局和自治区地质矿产勘查开发局。
三、内设机构
根据上述职责，国土资源厅设15个职能处(室)：
(一)办公室
组织协调厅机关日常工作，负责有关文件的起草、重要会议的组织、文电处理、秘书事务、信息综合、新闻宣传、档案、信访、保密、保卫、接待、机关财务及资产管理等工作。
(二)人事教育与科技处
承办厅机关及直属单位的机构编制、人事管理；参与对地(市)国土资源管理部门领导班子和领导干部的考核与管理。负责编制职工培训规划，组织职工培训。负责办理出国人员手续和本系统职称管理。编制国土资源科技工作规划，组织综合调查、科技攻关和关键技术研究；组织科技成果的评审和推荐工作；对科技项目实施情况进行监督检查，推进科技进步，推广科技成果。
(三)政策法规处
负责承办与国土资源有关的地方性法规、规章、规范性文件草案的起草、修改和审核工作；组织协调厅内有关立法工作；组织有关法律法规的宣传教育；办理有关听证、行政复议、应诉等事宜；调研和起草我区有关土地资源、矿产资源、海洋资源的综合性政策建议。
(四)规划处
组织研究全区和重点地区国土综合开发整治的政策措施，编制和实施全区性及区域性的国土规划、土地利用总体规划、矿产资源保护与合理利用规划、海洋开发规划、海洋环境保护与整治规划、地质环境规划；参与编制地质勘查规划；负责土地利用计划的编制和管理；指导和审核基本农田保护规划、土地复垦规划、土地整理规划、未利用土地开发规划等专项规划和地方土地利用总体规划，负责建设项目用地预审和国土资源综合统计，参与报自治区人民政府或国务院审批的城市总体规划的审核工作。
(五)财务处
执行国家和自治区的财务会计制度，拟订我区有关国土资源的财务会计管理制度，监督管理直属单位的财务会计工作和国有资产；承担国家和地方财政拨给的耕地开垦费、土地变更调查资、地勘费等专项经费和其他资金的财务管理工作，组织编制经费预算和决算；负责国土资源厅的各项行政事业性收费的征收与管理，监督检查下级国土资源主管部门的有关收费；对土地有偿使用费，探矿权、采矿权使用费、价款，矿产资源补偿费，海域使用金等的征收和使用进行监督。
(六)耕地保护处
执行国家有关耕地保护政策法规，起草我区耕地特殊保护和鼓励耕地开发政策、农地保护和土地整治政策、农地转用管理办法，草拟我区有关本利用土地开发、土地整理、土地复垦和开发耕地规定；组织实施农地用途管制和基本农田保护；负责农地转用、征用土地和土地开发、整理、复垦项目的审查报批和验收。
(七)地籍管理处
