吉林省林业厅全权负责生态草建设工程的日常管理和组织协调工作，并对资金使用、工程质量实施监管；荒漠化治理基金会负责向社会筹集资金，分年度和工作量拨付给生态草建设任务所在县(市、区)的林业部门或具体施工单位。对治理3年后，验收不合格的建设单位或施工单位，必须限期补建，补建不合格的予以一定的经济处罚，直至吊销生态草经营执照。各县(市、区)林业主管部门负责本区域内生态草建设的行政管理和技术指导，也可直接参与工程施工。
三、治理措施
按生态草建设工程要求，坚持乔灌草结合、工程措施与生物措施结合、封育与补种结合、禁牧与舍饲结合。具体治理措施分为封、补、种、改四种方式：“封”，就是采用工程围栏的方式把治理地块围封起来，防止牛羊啃食和人为破坏，促进草地植被自然恢复；“补”，就是对较大裸露的碱斑地块，实施浅翻轻耙、补播适宜草种，人为增加草地盖度；“种”，就是对基本没有植被的地块，采取大面积播种适宜草种的方式，迅速恢复其植被；“改”，就是允许经营者继续增加投入，进行草场改良，优化草质。也允许林业部门在治理后的草地上营造生态草防护林，巩固治理成果，提高草地的生态效益和经济效益。
四、认治政策
对认治者的权益，各级政府要依法予以保护，并公开向认治者承诺：(一)自愿捐资、无偿投入的认治者，由吉林省或县(市、区)政府予以树碑立传，昭示后人。(二)对于出资认治者，保护其经营期内的收益权、转让权、赠予权和继承权。(三)对被认治的“三化”草地，由县(市、区)林业部门负责长期管护。(四)允许认治者利用被认治面积5%以内的土地，用于建管护房、挖鱼塘、种植蔬菜等必要的生活设施建设。(五)生态草建设用地，由当地政府按有关政策规定，授权林业部门治理，并由林业部门无偿提供给认治者。
五、组织管理
吉林省人民政府成立“关注森林百万亩荒漠变绿洲行动”领导小组，由分管林业工作的副省长任组长。领导小组下设办公室，负责协调、组织、实施等各项具体工作，并在北京设立咨询联络处。同时成立吉林省荒漠化治理基金会，负责资金筹集、管理工作。各有关县(市、区)成立领导小组，由主管领导任组长，负责本县(市、区)生态草建设工程的组织协调工作。在县(市、区)林业部门设立生态草建设办公室，负责工程的具体实施和项目管理。本办法由省林业厅负责解释。
