(二)建设项目普遍超规模，而且未及时办理调整概算手续，致使大部分收费项目没有办理竣工决算。大部分公路收费项目由于地方政府盲目扩大建设规模，项目建成后又没有及时办理调整概算审批手续，造成建设项目无法进行竣工决算，因而无法确定还贷基数和收费期限。在全省242个非经营性收费站中，就有185个站负责还贷的项目超规模投资建设，有的超出数倍。如东莞长安收费站，省计委批准工程预算8828万元，实际投资65340．15万元，超规模640．15％。一些收费项目已经收费多年，后又将几经扩大规模建设所增加的投资纳入已建成的收费站“收费还贷”，造成还贷基数不断扩大，收费还贷负担沉重。
(三)不按程序申报收费，擅自批准经营或转让收费权。按照中央和省的有关规定，收费公路不管是直接融资还是收费权转让，都必须经省有关部门批准，但一些地方不按此规定办事，擅自批准中外合资、合作收费公路项目或转让收费公路经营权。全省176个经营性收费站中，就有68个是市、县自行批准的；其中广州市32个经营性收费站，有24个是自行批准的；肇庆市19个经营性收费站，有13个是自行批准的；更有甚者，三水市自行批准三水大桥收费站转为经营性，且经营期限55年。因此，致使我省部分收费效益好、即将收回投资的非经营性收费站，因各地擅自转为经营性收费站从而延长了收费期。
(四)高速公路没有实行联网收费，影响了通行效率。我省高速公路投资主体较为复杂，多数都涉及外资，目前还没有实行联网收费。一路一公司、一段路两个主线收费站的现象很普遍，造成高速公路主线收费站较多，影响了高速公路通行效率。如广州至汕头，经北环、广深、机荷、深汕西、深汕东几条高速公路，400多公里就有10个主线收费站。
(五)部分收费站效益太差，“还清本息即撤销收费站(点)”的规定难以落实。效益较差的收费公路大多位于山区，大部分是“八五”、“九五”期间设立的。由于车流量少，50％以上的站收费不足以支付贷款利息，如河源市紫金县，共设有6个收费站，收费公路建设投资共30768万元，而2000年收费最多的站只收123万元，最少的只有16万元，6个收费站2000年的收费总额为346万元，远远不足以支付贷款利息，债务越背越重。
(六)收费公路项目财务管理不规范。目前，全省收费公路项目财务管理存在的不规范问题突出表现在：全省未有统一的会计核算制度，造成收费项目统计核算不规范；非经营性收费站未实行统一的“收支两条线管理”；管理费支出严重超支；收费票据不统一等。
二、我省清理整顿公路收费站的措施
