直接费用是指课题研究过程中使用的可以直接计入课题成本的费用。一般包括人员费、设备费、试验材料费、燃料动力费以及其他研究经费等。人员费是指课题组成员的工资性费用。对所在单位有事业费拨款的课题组成员，其所在单位应按照国家规定的标准从事业费中及时足额予以支付。国家或本市另有规定的，按照有关规定执行。
间接费用是指为实施课题而支付给依托单位直接为课题服务的管理服务人员的人员费、现有仪器设备和房屋的使用费或折旧费等。间接费用占课题经费支出的比例，最高不得超过15％。
第十五条 课题资助方式根据课题规模以及管理工作的需要，分为成本补偿式或定额补助式。
成本补偿式资助方式是指对受资助课题的成本费用进行补偿的资助方式，最高为全额。由归口部门会同财政部门对此类课题预算建议书进行审查并批复。课题支出必须严格按照批复的预算执行。
定额补助式资助方式是指对受资助课题提供固定数额经费的资助方式，资助额度依据评议专家的意见和经相关的财政、财务政策审核后确定。
第十六条 由归口部门会同财政部门从目标相关性、政策相符性和经济合理性等方面，对课题预算进行审核，确定课题经费预算。
第十七条 计划管理费是指由归口部门使用、为管理科研计划及其经费而支出的费用，一般包括在规划与指南的制定和发布、招标、课题遴选、评审、预算评估、监理、跟踪检查、验收以及后评估等科技管理活动过程中所支付的费用。计划管理费总数不超过支出预算经费的5％。计划管理费预算由归口部门在此额度内编制，报同级财政部门核定后执行。该经费专款专用，如有结余，结转下年度继续使用。
第十八条 财政部门或归口部门根据批准的课题经费预算、用款计划、工作进度节点完成情况及经费结存情况，核定当期课题拨款额，并及时足额拨付课题经费；未按工作进度节点按时完成的，延迟或停止拨付课题经费。
按规定需实行政府采购的，经费拨付按政府采购办法的有关规定执行。
第十九条 经批准的经费预算必须严格执行，一般不做调整。由于课题研究目标、重大技术路线或主要研究内容调整，以及不可抗力造成意外损失等原因，对课题经费预算造成较大影响时，必须按各经费管理办法中规定的程序进行报批，经批准后方可对经费预算进行调整。
第二十条 实行定额补助式资助的课题只在结题时编制课题研究费总决算，不编制年度决算；实行成本补偿式资助的课题要编制课题研究费年度决算。课题研究费决算以会计年度为计算期，在规定时间内上报归口部门。自课题研究费下达之日起不满三个月的课题，当年不编报决算，其当年经费的使用情况在下一年度决算中编报。
