发展药品流通业的目标是，通过药品监督管理工作，不断扩大药品流通总量规模，使江苏省药品流通在质量和数量上保持在全国前列。通过重点扶持、培育优势企业，尽快形成以若干个跨地区的大型企业集团为主导的药品流通格局。同时，提高全省药品质量管理和现代管理技术应用水平，推行现代物流方式，从而真正在药品流通环节保证人民群众用药安全有效和购药的方便快捷。
(一)提高药品经营企业的规范经营水平。按照新修订的《
中华人民共和国药品管理法》及其《实施条例》的规定，药品监督管理部门要建立《
药品经营质量管理规范》(GSP)认证机构，健全GSP认证的各项管理制度，加快监督实施GSP的进程。2003年底之前基本完成对所有药品批发企业和零售连锁企业、大中型零售企业的GSP认证工作；2004年底完成对其他药品经营企业的GSP认证工作，全面完成我省GSP认证任务。通过药品监督管理部门的强制性认证，增强药品经营企业执行药品监督管理法律法规的自觉性，从根本上提高药品经营企业的规范化经营水平，坚决淘汰一批基础条件差的企业，并通过推进联合、兼并，加速市场资源向优势企业集中，增强我省药品流通业的整体竞争能力。
(二)推进优势批发企业和连锁企业扩大经营规模。重点扶持、培育和发展销售额50亿元以上的跨地区药品批发企业1家，进入全国特大型药品批发企业行列；销售额20亿元以上的药品批发企业3～5家，形成区域性的药品批发集团；优势批发企业的经营集中度明显提高，销售额占全省药品销售的70％以上。至2004年底，全省药品零售连锁企业的数量达到50家，连锁门店数量达到2500家以上，分别比2001年底增长1倍和2倍，药品零售连锁销售额占全部药品零售的75％，最大的跨省连锁企业门店数量达到1000家以上，形成3家全省性药品连锁服务品牌。
党的十六大报告中指出，要在更大程度上发挥市场在资源配置中的基础性作用，创造各类市场主体平等使用生产要素的环境，促进商品和生产要素在全国市场自由流动。为进一步适应我国加入世贸组织后更加激烈的市场竞争，不断提高流通产业的组织化程度和现代化水平，规范市场经济秩序，各级药品监督管理部门要鼓励具有优势的大型药品批发企业跨省、跨国发展，通过大规模收购、兼并、重组等手段，以资本为纽带，建立母子公司体制，或以品牌、商号、管理、配送等方式与药品生产企业和省外、国外的药品优势企业互助融合，获取新的规模优势和技术优势。要发展跨省市、广覆盖的集团性药品批发企业以推动我省药品生产企业及名牌产品走向全国乃至全世界，塑造江苏医药的品牌形象，最终形成以若干个组织结构集团化、经营方式集约化、投资主体和销售市场多元化的企业为骨干的新型药品流通格局。各级药品监督管理部门要满腔热情地支持企业深化改革，加快建立现代企业制度，进行规范的公司制改造，健全公司法人治理结构，组建大型药品批发集团。尽快改变经营方式陈旧、缺乏服务品牌和过度竞争等状况。鼓励药品零售连锁企业突破行政区划的局限，在更大的区域范围内增加门店数量，创造连锁服务品牌，放大品牌效应。已列为跨省连锁试点企业的，必须制定实施跨省连锁经营的计划，尽快实施跨省经营。门店的增加，可以采取新建直营点、兼并或组合其他零售网点的形式，也可以采取加盟连锁的方式，即允许其他各种投资主体的社会零售药店在双方自愿的基础上，以加盟店的形式加入零售连锁企业，实施统一进货、统一配送、统一字号、统一质量管理。
