第十二条 环境保护行政主管部门的主要职责：
(一)组织协调有关部门开展生活饮用水水源保护区的污染防治工作；
(二)对新建、扩建、改建项目严格执行国家有关建设项目环境保护管理的规定，严防新污染源的产生；
(三)依法实施水污染物排放许可证制度，在生活饮用水源保护区及其周围地区实行污染物总量控制；
(四)对保护区及排污单位排污口的水质进行监测；
(五)组织对水污染事故进行调查处理，在生活饮用水源受到严重污染，威胁供水安全等紧急情况下，报经同级人民政府批准，采取强制性应急措施，包括责令有关企业事业单位减少或者停止排污。
第十三条 水利行政主管部门的主要职责：
(一)积极开展小流域治理，做好水土保持工作，加强对生活饮用水水源保护区的管理和保护；
(二)协同环境保护行政主管部门对生活饮用水源保护区的污染防治实施监督管理；
(三)负责水利工程的规划建设、管理及水资源的统一配置、调度；
(四)合理设置取水口，督促取水单位设置标志牌、桩。
第十四条 规划、建设行政主管部门的主要职责：
(一)依法对饮用水水源保护区内建设工程项目进行统一规划管理；
(二)会同有关部门制定城市总体规划；
(三)对各县(区)城市污水集中处理设施的建设做出计划安排。
第十五条 环境卫生行政主管部门负责督促有关单位对城市管理范围内的生活饮用水水源保护区陆域的废渣、垃圾进行清除，以及排水管网设施和污水、生活废弃物处理设施的建设管理。
第十六条 公用事业行政主管部门负责制定饮用水源供水计划，并负责监督实施。
第十七条 卫生行政主管部门负责生活饮用水地表水源及地下水源一级保护区的水质卫生监测和卫生监督管理，并参与生活饮用水水源一级保护区域内水污染事故的调查处理。
第十八条 农业、林业行政主管部门应当加强生活饮用水水源保护区和周围地区的绿化工作，加强对保护区水源涵养林及相关植被的保护和管理。严格限制农药、化肥的使用，在保护区内大力推广种植无公害产品和以虫治虫、以菌治虫等生物防虫技术。
