六、部门协调，整体联动。卫生部门既要当好党委和政府的参谋、又要发挥主力军作用。要正确处理好防治非典与正常的医疗卫生工作的关系，要精心部署、统筹兼顾，把防治非典工作列为卫生工作重中之重，集中优势兵力，投入防治非典工作。在医疗过程中，各医院既要做到千方百计地抢救非典病人，又要切实做好医护人员的自身防护工作，进一步落实各项防护措施，同时还必须做好医疗废弃物消毒处理，确保做到医护人员零感染和医疗废弃物的无害化处理。凡因防护措施不到位，造成院内交叉感染和医疗废弃物扩散感染的要立即追究院长的责任。
交通、民航等部门要充分发挥行业管理部门作用，并积极主动与各地及省外有关部门配合联动，实行把关口岸前移，凡进出我省的交通工具(飞机、轮船、车辆等)及其人员一律在始发地先行进行卫生检验检疫及消毒；一旦发现有疑似症状的乘客，应拒绝其登车、船、机，就地留验观察，并迅速报告始发地和所属地卫生防疫机构处置。要严格执行对公共交通工具和公共场所的消毒制度。对进岛乘客(含渔民)要严格进行实名登记、填写《健康登记表》)和测量体温制度，实名登记内容包括乘客的姓名、性别、年龄、住址、联系电话以及从何处来、到何处去等详细情况。
海洋渔业部门要主动配合各地采取积极有效措施，切实做好渔船渔港的防治非典工作。既要加强进出港渔船的行业管理，减少我省渔船赴疫区海域作业、限制我省渔民登陆疫区渔港等口岸；又要防范疫区渔船及渔民登陆我省渔港等口岸传播疫情，特别要注意防范外省区人员通过搭乘渔船登陆我省。要在所有渔港设卡布控，加强渔港、渔船和渔民的卫生检验检疫和消毒工作。
农业部门要把农村防治非典工作与农村工作有机地结合起来，主动与卫生等有关部门协作健全卫生监控网络，一方面要摸清乡下农村疫情，另一方面要摸清城市农民工防非典情况，特别要重点掌握出岛务工、经商、上学返乡人员情况，做好动态管理，要采取强有力的防治措施，严防非典向农村扩散和蔓延；要积极与卫生、财政部门合作，落实农村贫困患者专项救助资金、及时提供免费治疗服务。
教育部门要加强学校和幼儿园、托儿所的防范措施。要严格执行晨检制度，杜绝有发热症状的学生和儿童进入。发现疑似症状者要立即采取隔离、报告、预防措施。学校应创造条件实行封闭管理，严禁外来人员和外来车辆等进入学校。岛外返校的教职工、学生，应进行必要的身体检查。
