除朝阳、海淀、丰台外的其他分局三种清单的电子数据申报成功的同时自动传输到市局，每月征期过后统一生成XML格式的电子文件，征期过后四个工作日内，由各局信息中心负责到市局专设的FTP服务器(地址：68.16.211.92，用户名：FPBD，口令：888888)上本局相对应的目录下(各局目录命名规则参见“二、相关说明”中第(六)项内容)取得三种清单的电子文件(XML格式文件)，并存放到分局FTP服务器的相应目录下。从2004年4月征期起，上述分局通过IC卡申报的货物运输发票电子信息取得方式也应严格参照上述说明执行。
若核对不符，必须提请纳税人将数据修改正确重新写卡后再进行申报，核对不符不能受理申报。若IC卡申报户修改数据后因特殊原因当期确实无法通过IC卡进行申报的，则转为手工受理申报。转为手工受理申报时，要提请纳税人按照手工受理申报的方式准备相应的申报数据。因此，使用IC卡申报的企业也应安装总局下发的海关完税凭证抵扣清单采集软件(一般纳税人版v1.1版)和废旧物资发票信息采集软件(一般纳税人版v1.0版)留以备用。
(三)网上申报：
企业使用网上申报厂商提供的前端软件采集三种清单的明细信息，申报时税务局端接收软件自动核对相关电子数据，相符后申报数据送入CTAIS系统，三种清单的电子数据自动传输到市局，每月征期过后统一生成XML格式的电子文件。
征期过后四个工作日内，由各局信息中心负责到市局专设的FTP服务器上相应目录下取得三种清单的电子文件(XML格式文件)，并存放到分局FTP服务器的相应目录下。FTP服务器的配置使用方法参考“一、各申报方式实现方法”中“(二)IC卡申报”的相关说明。从2004年4月征期起，通过网上申报的货物运输发票电子信息取得方式也应严格参照上述说明执行。
若核对不符，则提请纳税人将数据修改正确后重新申报，核对不符不能受理申报。若网上申报户修改数据后因特殊原因当期确实无法通过网上进行申报的，则转为手工受理申报。转为手工受理申报时，要提请纳税人按手工受理申报的方式准备相应的申报数据。因此，网上申报的企业也应安装总局下发的海关完税凭证抵扣清单采集软件(一般纳税人版v1.1)和废旧物资发票信息采集软件(一般纳税人版v1.0)留以备用。
二、相关说明
(一)各分局应通知纳税人从总局因特网网站(http：//www.chinatax.gov.cn)下载纳税人端海关完税凭证抵扣清单采集软件和废旧物资发票信息采集软件。如纳税人没有条件上因特网，分局应在大厅提供软件下载或提供软盘安装。IC卡和网上申报的前端采集软件由相应的厂商为纳税人进行安装和升级，各分局应予以配合。
