三、内设机构
根据上述职责，自治区卫生厅设14个职能处（室）。
（一）办公室。
协助厅领导处理政务和机关日常工作，协调和督办各处室的业务工作，制定厅机关各项工作制度；协调综合性政策调研和草拟工作；负责机关综合性会议组织、政务信息、新闻发布、卫生宣传、文电处理、秘书事务、机要保密、文书档案管理、群众来访、信访工作；负责组织协调自治区人大代表建议、自治区政协委员提案的办理工作；负责协调安全生产和社会治安综合管理；联系卫生社团组织工作。
（二）人事处。
研究草拟全区卫生人才发展规划，负责厅机关和直属单位机构编制、国家公务员管理和直属单位领导班子建设。按干部管理权限，负责厅直属单位的领导干部考察、任免和报批工作；负责直属单位干部职工调配、出国出境人员政审和人事、编制、职称管理及劳动工资、福利保险工作；协同有关部门做好大中专毕业生就业指导、聘用和军队转业干部安置工作；负责厅机关、直属单位干部培训和技术工人岗位考核；协同有关部门草拟全区卫生专业技术职称晋升政策、标准，组织实施全区卫生系列高级专业技术资格的评审工作；指导或协同做好职称聘任后的管理工作；做好厅直属单位高级专家及知识分子管理工作；负责全区性卫生系统评先表彰工作。
（三）规划财务处。
协同有关部门草拟全区卫生事业发展总体规划，统筹规划全区卫生资源的配置；协助财政部门研究草拟全区卫生财务会计管理制度及各项财务管理办法；协助政府价格主管部门制订卫生服务收费的政策标准，研究提出卫生服务价格建议；根据卫生发展规划与政策，协调有关部门争取和落实卫生事业发展的有关物质条件；组织全区重大卫生投资项目的立项和宏观管理；对厅机关和直属单位的发展规划、财务、基本建设、技术改造、技术装备、国有资产实施管理和监督；负责全区大型医疗设备的规划布局；协调利用国内外资金工作；对区直医疗卫生单位财务收支、基建投资项目等进行内部审计监督；组织指导本系统内部审计业务；负责卫生产业的指导以及卫生信息网络系统规划和卫生统计工作。
（四）卫生政策法规处。
负责承办卫生行政地方性法规、规章、政策的计划、修改、论证、调研、审核等组织协调工作；负责卫生行政复议和行政应诉工作以及卫生行政赔偿的审核工作；组织协调全区卫生系统普法与依法治理工作；负责开展卫生法制宣传教育与培训工作。
（五）卫生应急办公室（突发公共卫生事件应急指挥中心）。
