（四）理化学科
理化卷采用闭卷笔试形式，总分120分。根据一期课改和二期课改教材不同的情况，试卷采用一卷分叉的形式，试卷含有共同部分和分叉部分，分叉部分原则上不超过20%。
物理学科部分为70分，适合一期课改教材的试卷中力学约占40%，光学与热学约占20%，电磁学约占40%；实验内容分布在以上各项中，约占总量的15%。适合二期课改教材的试卷中力学约占50%，光学与热学约占17%，电磁学约占33%，实验内容分布在以上各项中，约占总量的17%。
化学学科部分为50分，适合一期课改教材和二期课改教材的试卷中基本概念和基本理论都约占65%，化学实验都约占25%，化学计算都约占10%。
（五）思想政治（思想品德）学科
考试形式为开卷，考试所携带资料不受限制。考试时间为70分钟。试卷卷面总分为100分，考试成绩按“优秀、良好、及格、不及格”四个等第表述。卷面成绩90分及以上为“优秀”，75—89分为“良好”，60—74分为“及格”，59分及以下为“不及格”。
以《〈全日制九年制义务教育〉思想政治学科课程标准》（2003年11月第4版，2003年11月第6次印刷）为命题依据，主要内容依据《思想政治》九年级教材（2003年8月第5版，2004年8月第7次印刷）和2004年7月—2005年5月的国内外重大时事政治。试卷题型有填空题、单项选择题、不定项选择题、辨别改错题、问答与分析题。
（六）理化实验操作技能
初中理化实验操作技能等级考试以观察和技能为主，命题依据是上海市全日制九年制义务教育物理、化学学科课程标准中学生实验的有关内容与要求。
二期课改试验基地学校初中理化实验操作技能等级考试的命题依据是2002年出版的《上海市中学物理课程标准（征求意见稿）》和《上海市中学化学课程标准（征求意见稿）》中基础型课程部分学生实验的有关内容与要求。
六、管理制度
根据教育部《关于基础教育课程改革实验区初中毕业生考试与普通高中招生制度改革的指导意见》（教基[2005]2号）的精神，2005年本市初中毕业生学业考试工作要建立命题、审题和阅卷制度，命题人员和审题人员必须分开。语文、英语、数学、理化试卷由市教育考试院统一命题，在同一时间由区组织考试和阅卷；思想政治（思想品德）试卷由市教委教研室命题，在同一时间内考试，由区县组织阅卷（返沪考生的政治试卷由市教委教研室单独命题，由区县组织考试和阅卷）；理化实验操作技能等级考试由市教委教研室命题，区县组织实施。
