违反本办法第十一条第二款规定，推广未经审定和认定的畜禽品种，按《
种畜禽管理条例》第
二十三条的规定予以处罚。无违法所得的，由农业行政主管部门处以2000元以上1万元以下的罚款。
第三十五条 违反本办法第十四条、第二十一条、第二十三条第（四）项规定的，按《
种畜禽管理条例》第
二十三条的规定予以处罚。无违法所得的，由农业行政主管部门处以3000元以上3万元以下的罚款。情节严重的，由发证机关依法吊销《许可证》。
第三十六条 违反本办法第二十四条规定，由农业行政主管部门责令畜主限期对种公畜予以去势或者淘汰；不去势或者不淘汰的，强行对种公畜予以去势或者淘汰，并处以500元以下的罚款。
第三十七条 违反本办法第二十三条第（一）、（二）、（三）、（五）项，第二十六条规定的，由工商行政管理部门责令其限期改正，对所经营的种畜禽按商品畜禽处理，并可处以1000元以上2万元以下罚款；造成损害的，违法者应当依法予以赔偿。
第三十八条 违反本办法有关动物防疫、广告管理规定的，按照动物防疫、广告管理等法律、法规、规章予以处罚。
第三十九条 农业、工商等行政部门有下列行为之一的，由上级行政主管部门或者行政监察部门按照干部管理权限，对负有责任的主管领导和直接责任人员给予行政或者纪律处分：
（一）未按照本办法规定的权限、条件、程序、期限核发《许可证》的；
（二）违反本办法规定实施行政处罚的；
（三）违反本办法第三十条规定，对移送的案件无法定事由不予处理的；
（四）未依法实施监督管理，造成本行政区域种畜禽生产经营秩序混乱，并产生不良后果的；
（五）有其他滥用职权，玩忽职守，徇私舞弊行为的。
第七章 附则
第四十条 《许可证》、《种畜禽合格证》的式样由省农业行政主管部门统一印制。证件的核发不得收取任何费用，所需经费列入财政预算。
