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（2）淮河下游平原生态亚区。以江淮冲积平原为主，地势平坦低洼，湖泊众多，是内陆湿地生物多样性丰富地区，为全省重要的农业基地。主要生态问题是：湖滩湿地开发利用过度，湖泊调蓄功能下降，洪涝灾害较为严重；工业、生活污水排放及农业面源污染、水产养殖业污染等造成部分湖区水质恶化。生态保护和建设重点是：限制、调整湖滩生产活动，严格禁止围湖造地，保护和恢复湖泊蓄洪滞涝功能；加强湿地自然保护区的建设和管理，保护湿地生物多样性；加强洪泽湖、高邮湖、宝应湖、邵伯湖及入江水道等重点水域的污染防治；大力发展无公害、绿色和有机食品，改善农业生态环境；加强水利工程体系建设，提高防洪排涝标准。
2．长江三角洲平原生态区
包括扬州市市区、仪征市、江都市新通扬运河以南地区，泰州市市区、姜堰市新通扬运河以南地区、泰兴市、靖江市，南通市除启东市、海安县划入黄淮平原生态区地区及海安、如东、通州、海门四县（市）沿海以外地区，以及南京、镇江、常州、无锡、苏州五市。该区分为3个生态亚区。
（1）沿江平原丘岗生态亚区。以长江冲积平原为主，兼有低山、丘陵、岗地。长江干流水量丰富、水质较好，是江苏重要水源地。主要生态问题是：沿江工业发展迅速，长江水质受到威胁；城市化、工业化发展使自然生态系统遭到一定破坏；丘陵山地和高沙土地区水土流失较为严重。生态保护和建设重点是：加强工业化、城市化过程中的生态保护，严格控制对城市周边森林生态系统的破坏；积极推进产业生态化改造，大力发展循环经济；加强沿江各个饮用水水源保护区和调水水源保护区管理，有效保护水源地；强化开发区建设的环境管理，避免无序开发；认真贯彻省人大常委会《关于限制开山采石的决定》，搞好开山采石区的水土保持，加快生态修复。
（2）茅山宜溧低山丘陵生态亚区。是江苏森林主要分布区，自然生态系统和景观保存较好。主要生态问题是：工业快速发展对环境造成了一定破坏；开山采石破坏了部分地区景观，并造成水土流失。生态保护和建设重点是：限制开山采石，积极开展采矿破坏地生态修复；保护和营造山区水源涵养林，保护改良丘陵、草地资源，防止水土流失；严格治理工业污染，加强饮用水源地的保护。
（3）太湖水网生态亚区。以平原为主，地势低平，湖泊众多，河网密集，土壤肥沃，是江苏经济最发达的地区。主要生态问题是：水环境恶化的趋势尚未得到有效遏制，部分地区地下水超采，珍贵渔业资源遭到破坏，一些风景生态林地与湿地被蚕食。生态保护和建设重点是：推进经济增长方式的转变，减轻经济社会发展对生态环境的压力；强化城市化过程中的生态环境保护和建设；严格旅游业生态环境管理，保护风景名胜资源；加强湿地保护，禁止填湖造地；全面落实地下水禁采、限采措施，防止发生地质灾害；加强渔业资源繁殖保护区的建设和管理，保护珍贵渔业资源；提高山区水源涵养能力，防止水土流失。
3．沿海滩涂与海洋生态区
包括从赣榆县向南到海门市的各县（市）沿海地区陆地部分、启东市全部陆地部分和我省管辖海域。该区分为2个生态亚区。
（1）沿海滩涂生态亚区。为滨海平原和滩地，海岸线绵长，生物资源丰富，江苏省已建的两个国家级自然保护区均位于该区。主要生态问题是：沿海滩涂开发利用使珍稀野生动物栖息地范围缩小；入海排污总量增加，近海水域环境质量下降。生态保护和建设的重点是：协调好环境保护和滩涂开发利用的关系，既科学保护，又合理开发；加强污染防治，控制污染物入海总量；保护建设好沿海生态防护林。
（2）近海海域生态亚区。大部分是低平的堆积海岸，盐城和南通部分地区岸外分布着大面积的辐射沙脊，沙带外侧至50m等深线处生物繁盛，形成良好的浅海渔场。主要生态问题是：大量污水沿入海河道排入近岸海域，海域环境污染加剧；沿海渔业资源明显衰竭，海洋捕捞产品数量和质量下降。生态保护与建设的重点是：控制污水向海洋的排放，改善沿海水域环境质量；严格控制海洋渔业过度捕捞，加强海洋渔业资源保护；适当发展近海养殖业；建设一批海洋生态自然保护区。
（二）积极发展以循环经济为核心的生态型经济
树立循环经济理念，探索发展循环经济的有效途径，大力推进产业结构调整，走新型工业化道路，积极发展生态农业、生态服务业，推动“资源—产品—废弃物”的传统增长模式向“资源—产品—废弃物—再生资源”的循环经济模式转变，降低资源消耗，减少环境污染，提高经济、社会和环境效益。
1．发展生态农业
结合资源、环境特点，探索适合各地自然条件和经济发展要求的生态农业模式，把农业结构调整与增加农民收入、防治农业面源污染和改善生态环境有机结合起来，逐步实现农业产业结构合理化、技术生态化、生产清洁化和产品优质化，促进农业和农村经济的可持续发展。
（1）推进生态农业县建设。以创建生态农业县为抓手，在全省范围内推广生态农业。在抓好已有2个国家级和12个省级生态农业试点县的同时，“十五”期间再建设13个省级生态农业示范县，抓好国家级江阴生态农业示范县和环太湖生态农业示范区建设。到2010年，全省力争有60％的县建成生态农业县。
（2）积极发展无公害农产品、绿色食品和有机食品。在农产品生产、加工、营销中推行清洁生产，开展农产品质量认证。制定化肥、农药合理使用的标准体系和技术规范。推广病虫草害综合防治技术，开发应用高效、低毒、低残留农药和生物农药。禁止在蔬菜、水果、粮食、茶叶和中药材生产中使用高毒高残留农药。大力提倡使用农家肥，推广测土配方施肥技术，提高化肥利用率。加快无公害农产品、绿色食品和有机食品标准制订工作，建设“放心食品”生产基地。到2010年，全省开发建设无公害农产品、绿色食品、有机食品基地5000万亩。
（3）推行畜禽养殖业清洁生产。畜禽养殖场的选址、布局，要确保达到环境保护的要求。在需特殊保护的区域，划定畜禽禁养区，对禁养区内的畜禽养殖场落实关停转迁计划。畜禽养殖要建立符合ISO14000标准的环境管理体系，采取先进工艺处理粪便污水，实现固液分离，建设沼气工程，生产有机肥料。到2010年，畜禽粪便综合利用率达90％以上。
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