第三十六条 项目完成后，应当按照要求进行项目验收。在项目验收时，项目承担单位除提供技术成果验收报告外，还需提供项目经费使用情况的总结报告。
第三十七条 市科技行政主管部门、财政主管部门负责对市科技研发资金的管理和使用进行检查监督。
市科技行政主管部门按照《深圳市科技计划项目管理暂行办法》的规定对项目进行管理，并逐步建立项目经费支出绩效考评制度，每年对项目经费支出绩效进行评估。市财政主管部门组织开展资金使用绩效评估。评估和考评结果将作为项目承担单位以后年度申报项目资格审查的重要依据。
对于非重点扶持的企业，在往年资助项目未评估之前先不予支持，待评估后再行决定。对于往年资助项目评估不合格的不予支持。
对于非重点扶持企业，经绩效评估确认从第一次享受无偿资助起三年内，企业绩效指标没有增长或增长不大的，市科技研发资金不再给予支持。
第三十八条 市科技行政主管部门、财政主管部门应会同监察部门聘请社会监督员，加强市科技研发资金管理和使用的监督。
第三十九条 对于违反财经纪律，弄虚作假、截留、挪用、挤占市科技研发资金项目经费的行为，市财政主管部门、科技行政主管部门可以根据情况采取通报批评、停止拨款、终止项目、收回市科技研发资金、3年内不受理资金申请，将项目承担单位及责任人列入不诚信情况名单等措施予以处罚。构成犯罪的，依法移交司法机关处理。
受委托的社会中介机构在项目和经费的评审、评估和审计过程中，存在弄虚作假、隐瞒事实真相、同项目承担单位串通作弊等行为的，取消其项目和经费的评审、评估和审计资格。社会中介机构提供虚假审计报告，造成市科技研发资金损失的，依法追究法律责任。
第四十条 参与评审、评估的咨询专家利用评审、评估的机会以权谋私或弄虚作假的，一经发现，取消咨询专家资格，并在媒体上公布；应追究责任的，按有关规定执行；构成犯罪的，依法移交司法机关处理。
第四十一条 市科技研发资金管理工作人员违反本办法，没有认真履行职责，致使市科技研发资金管理工作出现失误，审批资金有失公平、公正，或与相关人员串通、弄虚作假，骗取市科技研发资金给国家造成损失的，以及利用职务之便，搞吃拿卡要，收受他人财物的，依据有关规定追究责任人的相应责任；构成犯罪的，依法移交司法机关处理。
第四十二条 企事业单位的同一项目每年只能向市政府部门申报一次资助。凡以相同项目多头申报、恶意套取政府资金的，一经发现立即取消该单位所有项目的资助资格。
