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（一）领导组
组长由分管副市长担任，副组长由市政府分管副秘书长、市卫生局局长、市计委主任、市财政局局长担任，成员为市委宣传部、市卫生局、市监委、市药监局、市计委、市建管委、市教育局、市财政局、市科技局、市公安局、市司法局、市文化局、市环保局、市市容环卫局、市园林局、市农业局、市民政局、市劳动保障局、市商贸委、市经委、市旅游局、市市政局、市交通局、市广电局、民航山西省管理局、太原铁路分局、汽车客运公司等有关部门和各县（市、区）政府主要领导。
主要职责：在预防阶段，组织贯彻落实有关法律法规和省政府的指示，布置、检查全市各县（市、区）及有关部门重大疫病应急处理预案的制定和应急准备工作的落实。在应急阶段，以市重大疫病防控治指挥部名义，全面指挥预防、控制、治疗工作；宣布实行特别管制措施；统一安排、调用防病救灾物资、设备和人员；向省政府报告疫情和预防、控制、治疗工作。
（二）领导组办公室
领导组下设办公室，办公室主任由市卫生局局长担任。主要职责：
1、随时掌握各种重大疫病的动态，及时向市政府报告；
2、根据疫情预测结果，确定防控重点和目标；
3、组织预案制定及各项应急准备的检查工作；
4、组织重大疫病防控治领导组召开的相关会议，起草有关文件；
5、组织各专业组进行重大疫病防控演练；
6、组织实施本预案，制定应急控制措施；
7、在重大疫病发生后，迅速了解、收集、汇总和报告疫情、灾情；
8、与现场防、控、治各专业组以及市政府各有关部门的应急机构保持联系，及时传递有关信息、传达有关决定和指示；
9、审查重大疫病防控的宣传报道内容；
10、组织重大疫病的调查和评估，了解汇总工作情况；
11、处理领导组日常事务。
（三）各专业工作组
1、疫情控制组
组成单位由市、县（市、区）卫生局、各级疾病预防控制机构和卫生监督机构组成。组长由市卫生局分管局长担任，
副组长由市疾控中心主任、市卫生局卫生监督所所长、各县（市、区）卫生局分管局长担任。主要职责：
（1）组建防控应急队伍，安排应急控疫物资；
（2）开展各种重大疫病的日常监测、预报；
（3）制定不同级别重大疫病的预警防控力量配置、调动、联络指挥方案；
（4）开展突发公共卫生事件应用性研究，探索各种传染病的病因、流行特点、传播途径及流行因素等；
（5）建立健全重大疫病报告网络，收集疫情资料，及时准确报告疫情；
（6）开展流行病学调查、采样、技术分析和检验，追踪传染病病人或疑似病人的密切接触者，实施医学观察，为临床诊断和治疗提供参考；
（7）组织专家对重大疫病进行综合评估，初步判断重大疫病的预警级别，提出是否启动应急预案的建议；
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