根据“高起点、高水平、高标准”的原则，统筹规划，调整结构，集中力量建设一批省级重点学科建设，力争使其中部分学科接近或达到国内先进水平，构建布局和结构比较合理，具有福建优势与特色的高等教育重点学科体系，为提升高等教育综合实力及重点建设好一批高等学校奠定基础。
　　根据“调整结构、合理布局、择优确定、公平竞争”的原则，重点在机械工程、光学工程、材料科学与工程、信息与通讯工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、环境科学与工程、生物医学与工程、生物技术与工程、海洋科学与工程、生命科学、药学、管理科学与工程、哲学社会科学等学科领域，遴选确定100个左右的省级重点学科。依托省重点学科，确定一批有基础、有优势、有特色、有发展前景的学科建设项目，重点建设与经济建设和社会发展紧密结合、解决其重大科学技术问题的学科项目；注重建设好一批对经济社会发展作用重大的新兴、交叉学科项目；积极扶持填补或加强目前水平相对较低的空白薄弱学科项目；大力加强特色学科项目，力争使其中部份学科项目接近或达到国内领先水平，出一批重大的科技成果，推动学科建设上水平、上质量、上效益。
　　（二）创新平台建设项目
　　根据国家科技创新体系的总体布局及区域创新体系建设的要求，全省统筹规划，整合与优化资源配置，建立竞争、开放、流动、共享的运行机制，以增强高等学校原始性创新能力、技术创新能力和科技成果转化与产业化能力为目标，与国家和省的相关建设计划相衔接，以重点实验室、技术创新中心或工程研究中心和大学科技园为主构建高水平的科技创新平台，建设以解决经济社会发展中重大问题为目标的人文社会科学研究基地，促进学科优化与交叉，形成新的学科增长点，提升知识与技术的创新水平，争取有若干个创新平台和研究基地成为国家级或部级重点创新平台和基地，出一批具有显著经济社会效益、居国内领先水平的重大标志性成果。
　　紧紧围绕我省主导产业、高新技术产业发展的需要，面向我省产业发展及技术创新的重点领域，在电子信息、现代制造、化学化工、生命科学、生物制药和新材料等六大领域构建科技创新平台，重点建设一批面向科技前沿、具有国内先进水平的高等学校重点实验室，与有关部门和企业联合创建一批技术创新中心或工程研究中心，提高高等学校科技攻关能力、技术创新能力以及工程化和产业化的能力，使之成为我省源头创新、产业发展关键技术创新的主要基地和在国内外有一定影响的重要科研基地。
　　围绕国家和我省经济社会发展中的重大问题，进一步繁荣发展哲学社会科学，促进传统优势学科和新兴交叉学科的发展，促进哲学社会科学与自然科学的交叉渗透，建设以海峡西岸经济区战略研究和闽台经济文化研究为主的人文社会科学创新基地，加强海峡西岸经济区重大理论问题和现实问题研究，加强闽台区域经济文化的研究，使之成为在全国有一定地位和影响的人文社会科学研究中心。

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