(五)医疗器械处
组织实施国家有关医疗器械的法律、法规和规章，依法对医疗器械(含特种药械)的研制、生产、流通、使用进行监管；监督实施医疗器械、医疗器械类体外诊断试剂、卫生材料产品的法定标准和产品分类管理；负责规定以内医疗器械产品注册；负责第二类医疗器械注册产品标准的复核及第三类医疗器械注册产品标准的初审；负责第一类医疗器械生产企业备案；依法核发医疗器械生产、经营企业许可证；负责医疗器械不良反应事件监测和再评价；认可医疗器械临床试验基地；负责审批第二类医疗器械的临床试验；推行医疗器械质量体系认证和产品安全认证制度；负责指导医疗器械产品检测机构的业务工作；组织实施医疗器械质量监督抽验，发布全省医疗器械质量公报；审核医疗器械广告。
(六)药品安全监管处
负责药品不良反应监测、药品再评价和淘汰药品初审工作；监督实施中药材生产、药品生产、医疗机构制剂等质量管理规范；核发药品生产和医疗机构制剂许可证；按管理权限，负责药品委托生产的初审、审批和监督管理工作；负责办理药品出口销售证明书；依法监管麻醉药品、精神药品、毒性药品、戒毒药品和放射性药品的生产、经营和使用。
(七)药品市场监督处
贯彻实施药品流通法律法规，组织实施国家药品分类管理制度，监督实施处方药、非处方药、中药材、中药饮片的购销规则；监督实施
药品经营质量管理规范，依法核发药品经营许可证；依法对医疗机构药品使用实施监督；监督检定、抽验辖区内药品生产、经营、使用单位的药品质量，发布药品质量公报；监管中药材集贸市场；审核药品广告。
(八)财务处
负责全系统财务及资金管理工作；编制全系统经费预、决算并监督执行；负责全系统行政事业性收费的监督管理；负责全系统固定资产的购置和管理；负责统筹、协调、指导全系统基本建设；负责全系统的财务审计工作。
(九)人事教育处
承担全系统的人事、机构编制及劳动工资工作；按干部管理权限，做好有关干部的管理工作；指导全系统干部队伍建设，制订教育培训规划和规章制度并组织实施；负责药品从业人员的教育培训和全系统教育培训工作；协同有关部门实施执业药师资格认定制度，负责执业药师注册管理工作；承办全省药品检验人员专业技术职务评审的有关工作；负责全系统的外事工作。
机关党委。负责局机关和直属单位的党群工作。
纪检(监察)机构按有关规定设置，人员编制在局机关行政编制总额内单列。
