（一）投资计划管理程序。
机电排灌工程年度投资计划由各县（市、区）水利部门提出，报送同级发展改革（计划）部门，发展改革（计划）部门会同级财政部门审核后，由县发展改革（计划）和水利部门联合上报地级市发展改革（计划）和水利部门；地级市水利部门提出年度投资计划，报送同级发展改革（计划）部门，发展改革（计划）部门会同级财政部门审核后，由市发展改革（计划）和水利部门于每年6月底前联合向省发展改革委、水利厅上报下一年度计划；省水利厅于每年8月底前提出下一年度计划安排草案报送省发展改革委，省发展改革委会同省财政厅审核后于每年10月底前下达年度投资计划并抄送省府办公厅，省财政厅根据年度投资计划及项目施工进度拨付资金。
（二）上报计划要求。
上报年度计划应具备下列材料：地级市财政部门和县政府筹资方案的承诺保证书，项目可行性研究报告批复文件及初步设计批复文件各4份，初步设计文件2套。
六、工程建设管理
各市县政府要加强对农村机电排灌工程建设的领导，精心组织，层层落实责任制。各市、县应成立“实施省人大议案农村机电排灌工程建设协调小组”，下设办公室，挂靠同级水利部门，负责组织议案项目建设和管理工作。工程建设必须按照有关规定，实行项目法人制、招标投标制、建设监理制、合同管理制和质量监督制。项目完成可行性研究报告和初步设计审批程序后，以省下达投资计划代替新开工审批。工程竣工后，按照《广东省小型机电排灌工程竣工验收办法》的要求组织工程验收，办理有关验收手续。
七、体制改革
（一）各市县政府要切实加强领导，精心组织，尽快开展机电排灌工程管理单位的体制改革，力争2008年完成。对属于公益性的机电排涝工程，其管理人员经费、维修养护费用及运行电费，要纳入同级财政统一安排。对不属于纯公益性的机电灌溉工程，按照“谁受益、谁负担”的原则，由受益对象负担，对按规定收取受益对象缴费后正常运作仍有困难的，地方财政视财力适当给予经费补助。
（二）现有的市、县（市、区）机电排灌管理总站，要在五年内实现管养分离，只承担管理职能，将其维修养护职能剥离出去。承担管理职能的机构进行重新核准定编后，归属同级水利部门直管，其编制要科学定岗、精简高效，经费由同级财政负担；对于剥离出来承担维修养护职能、独立或联合组建专业化的企业（单位），地方财政对其转制给予一定的启动资金，省财政给予适当的启动补助。
