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专题2．重庆市现代农业科技问题研究
分析国内外及我市农业与农业科技发展的现状、问题、趋势以及农业发展对科技的总体需求；结合我市农业生产的地域特色，重点研究我市农业种植、养殖和农产品加工业、农业产业化和生态农业等领域的发展趋势、需要解决的关键技术和共性技术问题；提出我市农业科技发展的战略思路、战略目标、战略重点、重大科技任务、重大项目以及加速我市农业科技发展的政策和措施。
专题3．重庆市汽车（摩托车）及重大装备制造业科技问题研究
分析国内外汽车（摩托车）及重大装备制造业科技发展的现状与趋势；分析我市汽车（摩托车）及重大装备制造业在技术创新以及发展进程中所面临的重大战略需求和技术瓶颈；提出我市汽车（摩托车）及重大装备制造业科技发展的战略目标、发展思路及指导方针；提出以研制重大技术装备和成套设备集成为重点，提高行业装备制造水平和制造业装备水平中的重大共性关键技术和重大项目；提出提高我市汽车工业技术创新能力的对策以及在科技上要解决的共性关键问题；提出加快汽车、摩托车及重大装备制造业发展的措施、建议及重大科技项目。
专题4．重庆市改造提升传统工业的科技问题研究
分析我市传统工业发展的现状、面临的挑战和机遇，以及制约我市传统工业快速发展的技术原因；分析开发关键技术、工艺以及应用信息技术等改造提升传统工业的重点技术问题；分析研制开发主导产品和装备改造提升传统工业的技术发展需求和共性关键技术；提出我市信息化带动工业化、利用高新技术和先进适用技术改造、嫁接、提升传统工业的战略重点、目标、任务和重大科技项目；提出提高传统工业创新能力和市场竞争能力的对策措施与建议。
专题5．重庆市高新技术发展及产业化科技问题研究
分析国内外高新技术及产业化的发展趋势与我市现状；以建设长江上游高新技术产业化基地为目标，重点提出我市以发展信息工程、现代中药、创新药物及生物医学工程、环保工程、机电一体化和新材料等产业为主的战略研究重点方向和目标；明确提出能提高我市产业竞争力的重大共性关键技术、系统成套技术和重大科技项目；提出加速我市高新技术及产业化发展的对策措施和建议。
专题6．重庆市资源与能源开发利用科技问题研究
分析国内外资源与能源开发利用的现状和发展趋势；分析资源、能源科技发展态势及我市主要能源和资源的需求变化；研究能源、资源的开发利用和节约等面临的重大科技问题；进行资源、能源节约潜力以及能源和资源对我市国民经济建设保障度的研究；提出我市能源、资源开发的科技发展战略和目标；提出能源、资源重大技术发展方向、发展重点和重大项目以及促进我市能源、资源开发利用和节约的对策建议。
专题7．重庆市生态环境保护及三峡库区发展科技问题研究
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