二、目标和要求
(一)实施目标。
1．总体目标。2007年实现输水干线全线达到国家《
地表水环境质量标准》Ⅲ类水质标准(其中，黄河以南段水质稳定达到地表水Ⅲ类水质标准)，山东省进入输水干渠的化学需氧量控制在4．3万吨以内，氨氮量控制在0．43万吨以内；2010年实现输水干线全线持续稳定达到地表水Ⅲ类水质标准，形成清水廊道。
2．阶段目标。2005年南四湖、东平湖水体水质基本达到地表水Ⅲ类水质标准；2007年黄河以南段水质稳定达到地表水Ⅲ类水质标准，输水干线全线达到地表水Ⅲ类水质标准；2010年输水干线全线持续稳定达到地表水Ⅲ类水质标准。
(二)实施要求。
1．实行水质、总量、项目、投资、责任五位一体。以控制单元为基础，落实治污项目和投资，明确治污责任主体，严格实施排污总量控制措施，建立水质、总量、项目、投资、责任五位一体的治污机制。
2．节水优先、治污为本。南水北调东线工程的重点是治污，难点也是治污。要把节水作为治污工作的重要内容，有计划地关闭公共供水范围内的企业自备水源，强化公众节水意识，促进企业清洁生产，实现“节能、降耗、减污、增效”。调整优化经济结构，严格建设项目审批管理，坚决杜绝新增污染源，从源头减少污水产生；强化工业点源污染治理、城市污水处理厂及配套管网建设、农业及水产面源污染整治、输水沿线城镇生活垃圾的收集和处置、船舶油污水及生活污水和垃圾的收集和处置、清淤疏浚等治污措施；在加强污水治理的同时，提高污水再生利用率和农业灌溉用水效率，提高资源的利用水平，全程强化治污效果，体现“节水、治污、截污、导流、回用、整治”一体化的治污理念。
3．治污与调水工程建设相协调。治污工程要在布局、规模、投资、时序安排等方面，与调水工程建设同步进行，并适当超前，做到“清一段，通一段”，充分发挥调水工程的社会和经济效益。
4．总体推进、重点突破。根据东线工程治污工作的特点和调水工程通水的水质要求，按照区域内各城镇对输水干线水质影响程度和范围的不同，结合南水北调东线工程建设进度要求，划定重点治污区域和控制单元，优先实施重点区域治污项目，确保治污目标按期实现。
5．落实地方行政首长负责制。治污的责任主体是调水沿线汇水区设区的市人民政府。要以控制单元为基础，确定输水干线水质目标与治理措施，落实地方行政首长负责制。实行行政一把手亲自抓、负总责，逐级签订目标责任书，确保各项治污措施的落实。
