第六条 一级保护区为地下水补给和集中开采区，是重点保护区，其范围：
古交重点保护区：从西向东经罗家曲、古交、寨上、河口的汾河河谷。
西边山断裂带重点保护区：西铭、大虎峪、上冶峪、店头、马坊、南峪、李家楼、西梁泉以东；闫家沟往南沿铁路至罗城、北大寺、姚村、清源镇、水屯营以西；西铭、北寒、闫家沟以南；西梁泉、水屯营以北。
在一级保护区内，禁止新建、改建、扩建的矿井直接排放岩溶水；禁止新开凿岩溶水井；禁止擅自挖泉截流；禁止兴建影响泉水出流的工程；禁止倾倒、排放工业废渣；禁止将已污染的含水层与未污染的含水层的地下水混合开采；严格控制河谷地带孔隙水的开采；工业生产和生活污水的排放必须严格执行有关法律、法规的规定。
第七条 二级保护区为后山径流补给区和前山径流排泄区，其范围：庙前山、石千峰分水岭至王封村以西地区和以东地区。
在二级保护区内，应当搞好水土保持，植树造林，涵养水源，进行地下水回灌；对现有开采岩溶水的单位，限量取水，总量控制。严格控制开山采石和开采岩溶水；禁止新建、改建、扩建的矿井直接排放岩溶水。
第八条 三级保护区为冲积洪积平原区，其范围：西边山沿线以东汾河以西地区。
在三级保护区内，严格控制打新井，对泉水和城乡自备井，实施定量取水，总量控制。
第九条 晋祠泉域水资源管理机构应当做好泉域水资源的评价和地下水资源动态监测工作。
任何单位或者个人不得侵占、破坏地下水资源动态监测设施。
第十条 在晋祠泉域保护区内取用地下水、地表水的单位或者个人，须向县（市、区）水行政主管部门提出申请，经晋祠泉域水资源管理机构审核，报市水行政主管部门批准，并领取取水许可证。
在晋祠泉域保护区内开采地下水实行总量控制，年度开采计划由晋祠泉域水资源管理机构确定，并报市水行政主管部门批准后实施。
第十一条 在晋祠泉域保护区开凿岩溶水井的，开采单位须向县（市、区）水行政主管部门提出申请，经晋祠泉域水资源管理机构审核，报市水行政主管部门批准。
