（二）自查整顿。
对通过“四证”审核的矿井，凡在煤矿安全程度评估中被评为A级或B级的，以边生产边整改的方式进行专项整治；凡在煤矿安全程度评估中被评为C级或D级以及尚未进行评估的，必须立即停产整顿。
取得参加本阶段整治资格的矿井，要对照《
煤矿安全生产基本条件规定》查找本矿所存在的问题，制定完善的整改方案，明确整改时间和整改责任人，逐项进行整改。整改方案中涉及法律、法规规定须由有关部门审批的事项，必须依法履行审批手续。各设区市、县（市、区）政府及其有关部门要认真督促所辖煤矿进行整改。
（三）逐级验收。
1.矿井按规定整改到位后，由煤矿企业写出整治情况书面报告，连同《
煤矿安全生产基本条件规定》中明确的矿井有关图纸、作业规程、灾害防治措施、救护协议等资料，上报当地政府申请验收。其中，县属国有煤矿和已改制重组的原县属国有煤矿向县（市、区）煤矿安全整治领导小组申请县级验收，设区市属国有煤矿向设区市煤矿安全整治领导小组申请市级验收。已改制重组的原设区市属国有煤矿是向所在县（市、区）申请县级验收还是直接向设区市申请市级验收，由各设区市人民政府自定。
2.县（市、区）煤矿安全整治领导小组接到煤矿企业的验收申请后，应及时报告县（市、区）政府。县（市、区）政府要及时组织安排有关部门人员组成验收组，赴煤矿现场按照《
煤矿安全生产基本条件规定》进行逐条验收，按“市、县属国有煤矿和改制重组煤矿专项整治报审表”、“市、县属国有煤矿和改制重组煤矿专项整治验收表”填写验收意见并签名，报县（市、区）煤矿整治领导小组和政府签署意见。
根据对参加本次专项整治矿井的验收情况，县（市、区）政府必须形成“验收合格”、“停产整顿”或“关闭”的意见。属于关闭的，由县（市、区）政府依法予以关闭；属于停产整顿的，必须明确整改期限（最迟不得超过2004年6月30日），限期完成整改工作，否则依法予以关闭；属于验收合格的，由县（市、区）煤矿安全整治领导小组将资料上报设区市煤矿安全整治领导小组，申请市级验收。
3.设区市煤矿安全整治领导小组接到县（市、区）或煤矿的验收申请后，比照前述规定的县（市、区）的验收程序和要求，逐矿进行市级验收，填写“市、县属国有煤矿和改制重组煤矿专项整治报审表”和“市、县属国有煤矿和改制重组煤矿专项整治验收表”。对验收合格的煤矿，由设区市煤矿安全整治领导小组将资料上报省煤矿安全生产秩序整治工作领导小组，同时报送江西煤矿安全监察局，申请省级验收。
