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(七)药监部门：负责对非典防治所需药品、生物制品、医疗器械、卫生材料的质量监督管理。
(八)科技部门：负责非典的科学研究工作，组织科研单位、大专院校、疾病预防控制机构和医疗机构对非典在高原环境下的发病机理、治疗药物(特别是藏药)、诊断、预防药物和手段的研究；组织开展全区科研合作与交流。
(九)工商、物价和质监部门：负责防治药品的市场监管，及时查处流通领域制售假冒伪劣药品和相关商品行为，严厉打击借防治非典名义从事的各种违法违章行为，切实维护好市场秩序。对防治药品、医疗器械和人民生活必需品价格进行监测，适时采取价格干预措施，对趁机制售假冒伪劣药品及相关产品，囤积居奇、哄抬物价、行骗牟利、扰乱市场秩序的不法经营者要依法处理，从重处罚。
(十)民政部门：负责用于非典防治的社会捐赠款、物的接收、管理和使用工作；负责对非典死亡患者的尸体及时、就地消毒火化；负责对殡仪馆工作人员的培训；对因患病致贫的城乡居民给予社会救济。
(十一)环保部门：负责对医疗废水和医疗垃圾处理处置设施运行情况进行监督管理，确保正常运转和无害化处理；监测医疗废水和医疗垃圾污染物排放情况；负责对医疗废弃物收集、储存、运送、处理的环境污染防治工作统一监督管理。
(十二)出入境检疫检验机构：收集提供国外疫情动态和信息；加强国境口岸、航空出入境检验检疫工作，防止非典的传入和传出，对可疑病人，做好临时隔离工作，并报告当地卫生行政部门和疾病预防控制机构；对病人的密切接触者进行医学观察，污染物及其污染区立即进行严格彻底的消毒处理。
(十三)交通、民航、旅游部门：负责对乘客、游客进行健康检测、医学观察，对来往疫区的交通工具进行消毒处理；设置留验站，对交通工具、旅游饭店、宾馆及旅游景点上发现的可疑病人，应当立即采取临时隔离和预防控制措施，严防疫情通过交通工具、旅游饭店和宾馆扩散，并向当地卫生行政部门和疾病预防控制机构报告。
(十四)人事部门：制定稳定非典防治队伍和参与应急处理人员的激励政策。
(十五)建设部门：负责有关部门和单位落实建筑工地相关人员、建筑物及其配套设施的各项疫病预防控制措施。负责对全区建设系统施工企业非典防治知识宣传，督促检查施工企业落实非典防范措施。
(十六)教育部门：负责组织制定学校非典预防控制工作方案，做好学校、托幼机构的非典防治工作，开展学校健康教育，普及预防非典的知识。
(十七)广播、电视、报刊新闻媒体：在非典流行时，要及时制定宣传计划，负责法律、法规、规章及非典预防控制知识的宣传，开辟医疗卫生宣传栏目，加强应急处理工作的宣传报道；负责对先进人物、先进事迹进行宣传报道。
(十八)劳动保障部门：督促检查企业落实非典病人、疑似病人在医学观察、隔离治疗、住院期间的各项工资待遇；保证参加医疗保险的非典病人、疑似病人治疗费用的及时到位。
(十九)行政监察部门：监督检查各单位执行政府非典防治工作预案的贯彻落实情况，负责对非典防治工作中有关单位及其工作人员的渎职、失职等违纪行为进行查处。
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