原则上以家庭为单位参保，以村为单位筹集资金，参保村的农民参保率一般不低于80%。
（二）筹资标准
1.政府资助。市财政每年对参加新型农村合作医疗人员每人资助不低于15元。县（市、区）、镇（乡、街道）两级财政每年对参加新型农村合作医疗人员的资助一般每人不低于30元。
2.个人缴费。农民以家庭为单位，每人每年缴费标准一般不低于市、县（市、区）、镇（乡、街道）三级财政资助之和。
3.集体扶持。有条件的村集体经济组织对农民个人缴费部分给予适当补助。
4.社会资助。鼓励社会团体和个人资助新型农村合作医疗制度。
随着农村社会经济的发展和农民收入的增加，原则上每二至三年对筹资标准和补助标准进行适当调整。
（三）统筹范围
新型农村合作医疗制度以县（市）、区为单位进行统筹，实行统一筹资，统一管理。
实行县（市、区）、镇（乡、街道）两级管理的县（市）、区每年可提取农村合作医疗基金总额的3%左右，建立调节金，用于农村合作医疗基金调节。
各级农村合作医疗基金的风险由各级政府财政承担。各级政府要树立农村合作医疗基金的风险防范意识，建立风险化解机制。
（四）补助办法
农村合作医疗基金主要补助参加新型农村合作医疗农民的住院费用。特殊病种门诊费用是否列入补助，由各县（市）、区人民政府确定。因重大突发公共卫生事件所需的医药费用不在列支范围。
农村合作医疗基金起付线为当地农民年人均纯收入的10%左右，采取分级累进的补助比例，全年累计5000元以下部分费用补助比例为30－50%左右；5000元以上部分费用补助比例为50－80%左右，全年个人累计实际补助一般不超过30000元。
有条件的地方，可实行住院医疗费用补助与门诊医疗费用补助结合的办法，既提高抗风险能力又兼顾农民受益面。
三、医疗救助
（一）资助困难人员参加合作医疗。对农村低保对象、五保供养农民和重点优抚对象个人缴费部分给予全额补助；对经济欠发达的镇、村按实际参加人数给予适当补助。补助资金由市、县（市、区）财政各承担一半，具体由市财政商有关部门制定实施办法。
（二）医疗费用救助。对参加新型农村合作医疗的低保对象、五保供养农民、重点优抚对象和丧失劳动能力的残疾人住院费用，在合作医疗补助后的个人自负部分予以适当救助。其他人员发生大额医疗费用严重影响其基本生活的，对其合作医疗最高封顶线以上部分费用予以适当救助。救助费用由县级农村合作医疗基金中人均不低于5元资金和社会各界自愿捐助资金支付。
