未达到上述限额的取水，由取水所在地的区县（自治县、市）水行政主管部门审批、发放取水许可证并征收水资源费。
国家规定由长江水利委员会审批的取水，从其规定。
第五条 在计划用水、节约用水和水资源保护等方面成绩显著的单位和个人，由水行政主管部门给予表彰、奖励。
第二章 取水许可的申请与审批
第六条 除本办法第三条规定的取水外，利用取水工程或者设施直接从江河（溪流）、湖泊或者地下取用水资源实行取水许可制度。
实施取水许可，遵循公平、公正、公开、便民和及时的原则。
第七条 新建、改建、扩建的建设项目，地表水年取水量在10万立方米以上、地下水年取水量在1万立方米以上的，申请人应当按照水利部门和国家发展改革委发布的《
建设项目水资源论证管理办法》，委托有建设项目水资源论证资质的单位进行论证，编制建设项目水资源论证报告书。
第八条 申请人在报送建设项目可行性研究报告时，应当附具有管理权限的水行政主管部门或者流域管理机构对建设项目水资源论证报告书的书面审查同意意见。否则，项目审批部门不予批准。
第九条 建设项目的可行性研究报告经批准后，申请人应当向有管理权限的水行政主管部门提出取水许可申请；不列入国家基本建设管理程序的建设项目，可以直接向有管理权的水行政主管部门提出取水许可申请。
取水许可申请应提交以下文件：
（一）取水许可申请书；
（二）经批准的建设项目可行性研究报告（列入国家基本建设管理程序的取水工程）或建设项目水资源论证报告书（不列入国家基本建设管理程序的取水工程）；
（三）与第三者有利害关系的相关说明。
第十条 市级管理权限以上的取水许可申请由市水行政主管部门统一受理，其余取水许可申请由取水所在地的区县（自治县、市）水行政主管部门受理。
市、区县（自治县、市）水行政主管部门在收到申请人提出的取水许可申请后5个工作日内，对申请材料齐全、符合本办法规定条件的予以受理，并出具书面受理凭证；申请材料不完备或不符合本办法规定条件的，书面告知申请人应当在30天内补正；逾期不补正的，其取水许可申请不予受理。
