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1．发展无公害农产品是促进农业结构战略性调整的有效措施。其作用反映在三个方面：一是促进农产品质量提高，优化产品结构。食品安全是当前农产品质量的突出矛盾，发展无公害农产品将大大提高农产品质量安全标准，通过无公害农产品认证，有利于增强农产品加工企业的产品竞争力，促进农产品加工业的发展和农产品质量的升级。二是促进优势农产品发展，优化生产布局。把发展无公害农产品与调整农业生产布局结合起来，有利于加快优势农产品的发展，增强区域比较优势。三是促进产业化龙头企业发展，优化生产组织结构。通过“从农田到餐桌”的质量管理模式和无公害食品标志的品牌作用，可以强化“公司＋原料基地＋农户”的生产组织结构和利益联结机制，增强龙头企业的带动力，从而推动农业产业化发展。
2．发展无公害农产品是质量标准安全工作的重要组成部分。兵团是新疆重要的粮油、糖料、蔬菜、瓜果、畜产品和水产品的生产基地，由于多年从事农业生产，在农产品生产过程中；也存在农药、化肥、兽药、饲料添加剂等使用不科学的现象，这些都为食品的安全留下了隐患。发展无公害农产品对加强农产品质量标准、质量认证、质量监测、标准化生产等制度和体系建设有重要推动作用。
3．发展无公害农产品将成为兵团农产品扩大出口，积极应对入世挑战的重要工作。兵团农业发展要面向世界，实施走出去发展战略，无公害农产品出口已是兵团对外贸易的重要内容，产品涉及粮、棉、油、糖、蔬菜、果品、畜产品、水产品等。通过实施无公害农业生产，能够提高农产品的质量和安全性，突破农产品国际贸易中的“绿色壁垒”，增加市场竞争力，加快兵团农业结构调整的步伐。
4．发展无公害农产品是提高农业经济效益，促进农业可持续发展的需要。国内外市场表明，无公害绿色农产品比一般农产品价格高5％—20％以上，而且市场需求旺盛。开发无公害农产品可以提高农业经济效益，具有较好的市场发展前景。兵团应抓住西部大开发战略机遇，充分发挥西部自然资源优势与生态环境优势，大力发展无公害农业，开发具有地方特色的无公害农产品并形成规模，既可提高农业经济效益，增加职工收入，又保护农业生态环境，保证了人民身体健康，促进农业可持续发展。
(二)发展无公害食品的可行性
新疆得天独的农业生态环境是生产优质农、畜、瓜果产品的良好基地。兵团具有更好、更快地实施“无公害食品行动计划”的有利条件。
1．特色农产品资源优势。新疆地域广袤，光热资源丰富，具有气候干旱，降雨量少，蒸发量大，昼夜温差大的气候特点，属干旱荒漠、半荒漠灌溉农业；病虫害相对较少，农业生产环境污染较轻，对发展无公害农产品十分有利。农业是兵团的支柱产业，兵团农牧团场遍布全疆，是新疆重要的粮、棉、糖、油、蔬菜、瓜果、肉、蛋、奶和水产品的生产基地，有许多名特优产品，在市场中具有较强的比较优势。兵团的牛羊肉、马鹿茸、库尔勒香梨、哈密瓜、无核白葡萄、酿酒葡萄、加工番茄、制干辣椒、啤酒大麦、啤酒花等农产品更是以其优异的品质蜚声海内外。依托优势特色农产品资源的“白、红、绿”产业已成规模。2002年，兵团有四个单位被列入全国农垦无公害农产品示范基地农场创建单位。
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