二、岸线开发布局
依据岸线自然条件、产业和城市发展要求，合理划分港口码头、生活旅游、生态保护等岸线区域，实现集中集约式利用。总体开发布局思路为：主城和江北新市区以内的岸线资源主要配置高新技术产业、先进制造业和城市化滨江风貌建设；其他区域主要配置化工、冶金、能源等重化工业、现代化大型港口和物流园区建设。
港口码头岸线。适宜建设港口码头的岸线主要分布在：北岸七坝、浦口、大厂、西坝等岸段，南岸铜井、板桥、下关、上元门、新生圩、栖霞、龙潭等岸段。对现有的浦口、大厂、板桥、下关、上元门、新生圩、栖霞等港区码头进行功能整合及布局优化，进一步挖掘港口潜力，提高岸线利用率及码头泊位通过能力。对尚余宜深水港岸线的开发利用，结合经济发展及运量需求，优先建设公用码头。开发部分条件优良，产业需求旺盛的岸段，重点开发龙潭、西坝、七坝、铜井、三江口等岸段，其中长江二桥以下主要建设万吨级以上泊位，二桥以上主要建设5000吨级泊位。
过江通道岸线。过江通道岸线要求地质基础坚固，河势稳定，河道相对较窄。顺应跨江发展的需要，要留有足够适宜通道建设的位置。除已建和在建的3个桥位要留有足够的岸线供配套服务设施建设外，预留纬七路过江通道、石埠桥桥位、京沪高速铁路过江桥位、三江口桥位等岸段。根据发展需要，上述过江通道位置可进行适当调整。
取水口岸线。取水口布局在岸线比较稳定、上游没有污染、不产生严重淤积的畅流河段。对现有的江宁子汇洲、夹江、燕子矶、龙潭、桥林、浦口、八卦洲、黄天荡等取水口岸线加大整合力度，形成6个左右的集中饮用水水源保护地。在饮用水取水口上下游设立必要的水源保护岸线。
生活岸线。北岸浦珠一线约14公里岸线为江北主要的生活岸线，作为江北新市区的滨江风貌带进行城市功能开发建设；江南河西新城一线约20公里岸线以及下关岸线为主要的生活岸线，以体现优良人居环境和现代化城市形象的原则进行开发建设。
旅游岸线。以南岸燕子矶、幕府山滨江、城西夹江、江心洲及八卦洲等岸线为主，规划作为旅游岸线，把重要的自然景观和人文古迹所在地的岸段预留起来，保留岸线的自然风貌，开发旅游资源和改善环境，发展沿江的旅游产业。
生态岸线。生态保护岸线是生产性岸线之间的绿色隔断，具有维持岸线可持续利用的功能；近期不具备开发条件的岸线、严重淤积或崩坍的岸线、对控制河势有重要意义的岸线，应作为或视同生态岸线严格保护。生态岸线主要分布在北岸浜江－陈圩、长江大桥－大厂卸甲甸、西坝头－赵庄沟岸段，南岸慈湖口－下三山、江心洲夹江段、三江口－大道河口岸段。在生态岸线区域建设环保防护林和生态湿地，与城市建设、旅游建设紧密结合，达到沿江岸线利用与保护的有机融合。
三、航运功能建设
积极开发与整合深水和中深水岸线资源，加快航运枢纽设施建设，配套陆、空交通网络和物流园区，把南京港建成现代化、多功能的江海中转主枢纽港。以政策为先导，以资本为纽带，积极组建南京港口集团，实施大范围的港口航运资源整合，重点建设四个航运中心，巩固南京港作为上海国际航运中心副中心的地位。到2010年，货物吞吐量争取突破1亿吨，集装箱吞吐量达到150万标箱左右。
集装箱航运中心。调整南京港布局，将龙潭港区建设成为以集装箱业务为主，以增值业务为辅，多式联运发达，规划预留总吞吐能力300万标箱的专业港区。以龙潭港为核心，加强与镇江、扬州、芜湖等周边集装箱码头的协作，将南京发展成为长江流域集装箱航运中心。
液体化工航运中心。西坝规划建设液体化工专用泊位和工业泊位，与扬子港区一并成为为南京化学工业园区配套的专业化公用港区；整合江南江北液体化工码头，为南京及长江中上游地区的石化产业发展服务，形成液体化工航运中心。
煤炭航运中心。以华东、华南地区加快能源建设为契机，充分发挥铁路、港口兼备的货运优势，以南京港务局三公司煤炭专用港区和华能、南热等煤炭专用码头为依托，联合芜湖裕溪口等周边港区共同建设长江流域的煤炭航运中心。
冶金建材航运中心。以新生圩港区、梅山冶金码头、南钢码头、上元门、浦口地区码头为依托，联合镇江、泰州共同组建冶金建材航运中心。
第四章 基础设施建设
以综合交通建设为重点，完善沿江基础设施体系，塑造我市在全省沿江基础设施网的核心地位，增强我市对上海经济辐射的承接能力、对南京都市圈区域经济发展的服务能力。
