经济、计划、药监、工商、物价等物资供应保障部门：负责消、杀、灭及救治等防治药品、物资的生产、调运、储备和供应，平抑市场物价，打击制售假冒伪劣商品等违法犯罪活动，维护市场秩序。
公安部门：负责社会治安，维护社会秩序，打击违法犯罪活动。
宣传部门：负责宣传国家和省有关非典防治政策措施，宣传普及非典防治知识，发布新闻以及通报全省疫情情况，并向中央新闻单位提供有关防治工作信息。
(二)防治工作机制
非典防治工作坚持政府统一组织指挥；各有关部门分工负责、密切协作、上下联动、齐抓共管；最广泛动员群众，组织全社会力量开展群防群控的工作机制。
实行属地管理原则。非典的疫情监测、报告、医疗救治、控制处理和群防群治工作实施属地化管理，各部门、各单位必须无条件服从当地政府的统一指挥。同时，要求村委会、居委会等基层组织服从政府的统一组织指挥，在疫情监测、报告及群防群控工作等方面充分发挥基层组织作用。
实行严格的责任制和责任追究制。各单位要做好本单位的非典防治工作，单位负责人是第一责任人；各级各类活动的非典防治工作，实行“谁主办，谁负责”，由主办单位严格落实各项预防控制措施。要用法律要求、政治纪律、组织纪律、工作纪律来保证各项防治措施落实到位。对因领导不力、措施不落实、工作不到位而造成疫情传播的，将严肃追究有关领导和有关人员的责任。
实行群防群控。最广泛地动员、组织广大群众积极参与群防群控工作，自觉履行公民的责任和义务，开展爱国卫生活动，增强防病意识。
(三)防治组织保障体系
1、防治组织体系
(1)卫生行政部门
各级卫生行政部门成立由主要负责人任组长的防治工作领导组织，负责非典防治工作的统一监督管理；发生疫情后，立即组织有关专家判断疫情的严重程度，确定疫情波及的范围；组织疾病预防控制机构、医疗机构、卫生监督机构开展疫情监测、流行病学调查、疫情处理、医疗救治、技术指导、宣传咨询和监督执法工作；切实当好政府参谋；及时报告、定期通报防治工作情况、疫情信息。
(2)疾病预防控制机构
各级疾病预防控制机构负责疫情监测与预警，汇总、分析、评估疫情；对病人或者疑似病人及其密切接触者进行流行病学调查，对密切接触者采取必要的医学观察措施；指导医疗机构做好消毒隔离工作3对疫点进行隔离控制和消毒；组织开展健康教育宣传咨询和专业人员培训。
