在省政府领导下，根据省防治非典型肺炎工作领导小组的统一部署，督促、检查、指导、协调全省公安司法系统疫病预防工作，为全省防治非典型肺炎工作提供有力支持和保障。
(二)指挥部的任务
1.动员和组织本系统贯彻省委、省政府关于预防非典型肺炎工作的各项部署和要求，推动各项任务的落实；
2.组织开展非典型肺炎防治知识和防治措施的宣传教育活动；
3.组织开展《
传染病防治法》和《
传染病防治法实施办法》等相关法律、法规和政策的宣传教育活动；
4.推动开展以预防非典型肺炎为主要内容，以增强群众抵抗力为目的的爱国卫生运动；
5.按照“四早”要求，推动本系统疫病防控措施的落实，促进实施非典型肺炎的及早发现、及时控制、迅速报告；
6.督促本系统有计划地建设、改造公共卫生设施，重点对监管场所的污水、污物、粪便进行无害化处理；
7.督促本系统完成省防治非典型肺炎工作领导小组部署的紧急社会动员工作。
(三)指挥部的工作方法
1.依靠所在地政府和卫生行政管理部门及传染病预防控制机构搞好预防工作；
2.在发挥部门主体作用的同时，加大在预防非典型肺炎工作上的指导、推动、督促力度；
3.注意总结经验，交流信息，及时为省防治非典型肺炎工作领导小组提供相关工作建议；
4.坚持依靠科学、依靠法制、依靠群众，从实际出发，实事求是，及时准确反映情况。
(四)指挥部的组成
总指挥：牛海军 省政府副省长
副总指挥：骆德春 省政府副秘书长
成 员：陈占旭 省公安厅厅长
祝国治 省司法厅厅长
张升东 省政府副秘书长、省国家安全厅厅长
刘力群 省政府副秘书长、省信访局局长
王宪林 省工商局局长戴洪生 武警吉林省总队总队长
邹继宏 省财政厅副厅长
秦利明 省公安厅副厅长
冯明芳 省司法厅副厅长
李 彦 省工商局副局长
王海清 省监狱管理局中心医院院长
(五)指挥部的设置
指挥部办公室设在省司法厅，办公室主任由冯明芳兼任，副主任王为民(省政府办公厅综合三处处长)。指挥部下设宣传、防治、治安、综合四个工作组。
