软件出口企业若取得中国国际电子商务网会员资格后，可登录中国国际电子商务网软件出口在线登记网（网址：www.scrcentre.gov.cn）上的“软件出口合同管理”系统对合同内容进行在线登记；若未取得会员资格，则可以由市贸发局代理进行合同在线登记。
（二）提交材料：
申报企业进行在线登记后，向市贸发局提交以下材料：
1、软件出口合同登记申请书（要求介绍双方公司名称，出口方情况，合同概况）；
2、《软件出口合同登记表》（网上登记成功后生成）；
3、生效的软件出口合同副本（非中文本的须附中译文本，合同中必须明确软件出口方式：“海关通关方式”或“网上传输方式”）；
4、进出口资格证书复印件（首次办理时提供，验原件，“三资”企业不需提供）；
5、签约双方法律地位的证明文件复印件(首次办理时提供，国内企业交验原件)。
以上材料均须加盖申报单位印章。
有条件的企业可以通过厦门经贸信息网（www.sme.net.cn）提交上述材料，具体的提交办法另行公布在厦门经贸信息网上。
（三）市贸发局网上核对合同在线登记内容并发证。网上登记内容与合同相符的，3个工作日予以核发《软件出口合同登记证书》；不符的，市贸发局将通知修正，无误后3个工作日内予以颁发合同登记证书。
（四）软件出口合同登记部门：
市贸发局高新技术处，地址：湖滨北路外贸大厦六层，联系电话：5302615、5302555。
三、软件出口报关
软件出口有两种方式：一是“海关通关方式”，二是“网上传输方式”。目前海关只受理“海关通关方式”的软件出口。
对于“海关通关方式”的软件出口，其通关程序如下：
（一）“海关通关方式”软件出口是指以物质介质为软件载体出口的软件。
（二）软件出口企业到海关办理“海关通关方式”软件出口报关手续时，需提供以下材料：
1、《软件出口合同登记证书》；
2、《软件出口合同》（正本）；
3、外汇管理局发放的《出口收汇核销单》。
（三）报关办理部门：
1、对于快递或航空旅客随身携带的软件出口，由厦门海关驻机场办事处通关科受理，地址：高崎机场货物报验中心，联系电话：6028596；
2、对于邮递的软件出口，由厦门海关驻邮局办事处快递物品监管科受理，地址：厦门市湖滨南路6号厦门海关驻邮局办事处，联系电话：2282185、2281925。
