有污染物排入二级保护区和准保护区的单位，应当向环境保护部门提出污染物排放申请，经审核，污染物排放符合规定的，颁发排污许可证。任何单位和个人未经许可，不得排放污染物。
第二十一条 在保护区内航行的船舶，其防污设备应当符合国家船舶防污结构与设备规范的规定，持有船舶检验部门签发的合格证书。
港口或者码头应当配备含油污水、垃圾和粪便的接收与处理设施。
船舶的废油、残油、垃圾和粪便应当排入接收设施，不得排入水域。
第二十二条 因突发性事故对赣江饮用水水源造成或者可能造成污染，事故责任单位和个人应当立即采取措施消除或者减轻污染，并报告环境保护、卫生、水利等部门和城市公共供水单位，环境保护部门应当立即组织有关单位调查处理。
第二十三条 对保护区内已设置的属已建成的不符合本条例规定的项目和设施，市环境保护部门应当区别情况，提出搬迁、转产、关闭或者拆除的意见，报市人民政府批准后实施。
第二十四条 环境保护部门和有关监督管理部门的工作人员，有权按照水源保护的要求，对保护区内的单位进行现场检查，被检查的单位应当如实反映情况，提供必要的资料。
第四章 罚则
第二十五条 违反本条例规定，有下列行为之一的，由环境保护部门或者交通部门按照各自职责给予处罚：
（一）擅自改变或者损坏保护区标志的，责令改正，并可处以５０元以上５００元以下罚款；
（二）在保护区使用剧毒和高残留农药、储存有毒有害物质，或者在一级保护区堆置废渣、垃圾、粪便及其他废弃物的，给予警告，并可处以２０００元至５万元的罚款；
（三）未取得排污许可证向二级保护区或者准保护区排放污染物，但排放污染物未超过国家规定的排放标准的，给予警告，责令限期办理排污许可证，并可处以３００元以上５０００元以下罚款；不按照排污许可证规定排放污染物的，责令限期改正，并处以５０００元以上１０万元以下罚款，情节严重的可以吊销排污许可证；
（四）向保护区水域倾倒废渣、垃圾、粪便、废油、残油及其他废弃物，或者向一级保护区排放污水的，给予警告，并可处以５０００元以上１０万元以下罚款。被处以警告、罚款的单位和个人，并不免除消除污染、排除危害和赔偿损失的责任。
