——新一轮学科专业结构调整要大力增强优化意识。要根据经济结构调整的需要和学科专业的发展规律，大力培植新的学科专业生长点，减少低水平，低效益的重复，从本地区实际出发，努力创建学科专业的制高点，围绕这些制高点形成优势明显的学科专业群。突出学校的特色，体现新疆区情和优势，支撑区域经济支柱产业和特色行业的发展。
——优先发展信息科学、生命科学、新材料科学、资源环境科学、现代农业科学、畜牧业科学、能源科学、管理科学等高新技术类和急需的本科专业，培养大批高新技术人才和高层次科技、经营、管理人才；优先发展适应加入WTO急需的金融、法律、贸易等类本科专业，培养精通世贸组织规则的专业人才。
——大力发展与地方经济建设紧密结合的应用型专业。本科要紧随自治区产业结构调整步伐，加强应用型学科专业建设。高职高专要随自身的办学定位和社会职业岗位(群)的需要，加快人才培养模式改革，专业设置培养灵活多样。要打破传统学科的壁垒。紧密结合地方经济建设发展需要，科学运用市场调节机制，合理调整和配置教育资源，积极为地方经济建设输送各类应用性人才。
——鼓励加强传统学科专业的改革和改造，要加大使用信息科学等现代科学技术提升、改造传统学科专业的力度，实现传统学科专业新的发展。鼓励大胆创新，建立人才培养模式多样化的新机制。鼓励跨传统学科门类设置交叉学科专业、新兴学科专业、边缘学科专业，形成高校学科专业设置和人才培养多样化的新格局。特别要培养好综合性、跨学科的复合型人才。
——重视人文社会学科专业的建设与发展，加强人文教育和科技教育的结合。切实保障自治区艰苦行业和特种行业所需要的学科专业的建设与发展，适度发展基础性学科专业。在自治区整体宏观学科专业建设调整布局中，深入研究，合理确立急需学科、新兴学科、特种学科、人文社会学科和基础研究学科专业的比例关系，对社会和人才市场需求不旺的长线专业要进一步压缩，直至停办。
——学科专业结构调整，要通过专业设置和招生计划安排进行调控。各高等学校本专科专业设置要严格履行专业设置评估、论证、审核程序。要根据各地区经济和社会发展的需要和全自治区专业宏观布点及规模总量调整专业设置。严格招生计划，保证招生计划执行的严肃性。招生计划安排一定要与专业设置调整相一致，未审核备案的专业不得安排年度招生。
——学科专业结构调整，要普通高等教育与成人高等教育相互协调，区属高等学校和部属高等学校相互协调。在地方政府统筹下，统一规划。区属成人高等教育招生计划安排要经专业管理职能部门的专业审核，区外成人高等教育招生安排，要经相关计划部门和专业管理部门的审核，方可进行招生。地方高等学校调整学科专业要由其主管部门征求部属院校管理部门的意见，部属院校调整学科专业要由其主管部门征求地方管理部门的意见。
三、合理配置教育资源，强化调整后学科专业质量建设
学科专业培养质量是学科专业建设调整的重要方面。专业培养质量要符合社会对人才培养的业务和综合素质的要求。要认真研究高等教育发展所面临的新的形势和任务，着力处理好新形势下专业规模与质量、发展与投入、改革和建设的关系。一定要把学科专业质量建设摆到重要的议事日程，以质量为主线，推进高教事业的发展。学科专业结构的调整，规模的发展要以社会需求、办学基本条件和质量的最低保障为前提，要坚持规模、结构、质量、效益协调发展。
——高等学校要在学科专业结构调整的过程中，按专业的培养目标和要求，全面实行教育资源的重组配置，在教学、师资、设备、教材、实验实训、管理、公共服务体系等方面按培养要求重新调整，合理运行，确保学科专业建设质量。
