发挥乡镇中心卫生院的枢纽作用。乡镇中心卫生院是一定区域内的医疗、预防、保健技术指导中心，负责所在地的基本医疗和预防保健服务工作，积极开展医疗双向转诊，对区域内的一般卫生院进行技术和管理指导。乡镇卫生院要坚持预防保健工作与医疗服务相结合，确保公共卫生工作的落实。提高基本医疗服务水平，尤其要增强产科、计划生育、急诊急救等服务功能。在经济条件较好的地区，距县(市)城较近的乡镇卫生院可转向社区卫生服务职能。
加强村卫生所的基础作用。按照省级卫生行政部门规定的村级卫生所建设标准，完善工作制度与技术常规，建立健全健康档案，为农民提供安全便捷的常见病、多发病的诊治服务。
充分发挥中医药在农村卫生服务中的作用。要巩固和发展县(市)中医院，抓好学科建设，提高中医药学术水平和临床诊疗水平，大力普及中医药知识，推广中医药适宜技术，培训乡村中医药技术人员。乡镇卫生院要完善中医科建设，扩大中医药服务范围，满足农民对中医药技术的需求。
四、改革乡镇卫生院内部运行机制
改革乡镇卫生院院长任用与管理办法。县级卫生行政部门要坚持公开、平等、竞争、择优的原则，在全县(市)或更大范围内招聘作风好、懂技术、管理能力强、具有主治医师及以上职称的优秀人才担任乡镇卫生院院长，也可采取选任、考任、委任等多种形式任用。明确责任和权限，给院长充分的经营管理自主权、奖惩权和分配权。适当提高院长的待遇，将其工资和医疗保险单位缴费部分列入财政预算。要实行院长任期目标责任制，对不称职的卫生院长予以解聘，也可试行医院管理委员会领导下的卫生院长负责制。
改革人事制度。按照中共中央组织部、人事部、
卫生部《关于深化卫生事业单位人事制度改革的实施意见》(人发[2001]31号)精神，县级卫生行政部门要会同人事、编制等有关部门，依据乡镇卫生院的服务功能、服务区域内的卫生需求量和卫生院实际工作量，确定卫生院人员编制和人员结构，实行全员聘用制，因事设岗，按岗聘人，竞争上岗。严格控制卫生院非卫生技术人员的比例，有计划清退卫生技术岗位上的非卫生技术人员。逐步建立起单位自主用人、人员自主择业的人事管理机制。
改革分配制度。在执行事业单位工资政策的基础上，根据人事部门核定的工资总额，由院长按照按劳分配和生产要素参与分配的原则，自主决定内部分配。建立健全内部考核制度，使人员收入水平与其技术能力、服务态度和劳动贡献挂钩，逐步建立起重实绩、重贡献、向优秀人才和关键岗位倾斜、自主灵活的分配机制。
