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重点实施两大工程：
——水源涵养林工程。通过人工造林和封山育林等措施，建立天然阔叶林保护为主的生态屏障，保护和恢复森林植被。在“五江一溪”源头及两侧的浦城、松溪、建宁、泰宁、安溪、永春、南靖、平和、长汀、上杭、仙游、寿宁、周宁等30个县（市）造林更新17．8万亩，封山育林30万亩，低效林改造15万亩。
——水土保持林工程。重点对长汀、安溪等地的强度水土流失区进行治理，主要营造阔叶树或针阔混交林 11．2万亩，封山育林50万亩，优化森林结构，提高水土保持功能。
（五）沿海防护林工程
采取工程措施与生物措施相结合的办法，加快建设沿海防护林四期工程。重点抓好霞浦、罗源、莆田、长乐等地108公里基干林带建设，加快福安、福清、惠安、漳浦等地老林带更新与农田林网造林，推进长乐、东山、晋江、平潭等地40个沙荒风口治理，提高抵御风沙等自然灾害侵蚀的能力。同时，选择条件较好的林地，建设果竹基地，增强沿海地区林业发展后劲。力争到“十五”末期，沿海地区形成基干林带、护路护岸林、农田防护林、村庄绿化及其他有林地点线面、带网片、乔灌草有机结合，生态功能相对完备的综合防御体系。
（六）生物多样性保护工程
主要包括我省中亚、南亚热带典型地带和湿地自然保护区及重点野生动植物种保护。“十五”期间，重点续建武夷山、梅花山、龙栖山等3个国家级自然保护区，新建虎伯寮国家级自然保护区。同时抓好一批省级自然保护区，实施华南虎、南方红豆杉等重点物种保护工程、野生动物救护工程和野生动植物科研监测网络建设工程，重点保护国家一、二级保护野生动物。植物和沿海湿地红树林。
（七）生态农业示范工程
以生态农业县建设为重点，建立东山、芗城、同安、连江等15个国家级和省级生态农业示范县（市。区）；启动市级生态农业试点，建立不同区域不同类型的生态农业示范区，重点建设基本农田建设与保护工程、水土保持生态工程、林业生态工程、生态果茶园工程、农牧结合型生态农业工程、绿色食品工程、庭院生态工程、食用菌可持续发展示范工程、海水养殖生态工程等九大生态工程，推广耕地上推广模式、立体林业经营模式、山垄区域综合开发模式、生态果茶园综合建设模式水体立体养殖模式等5个生态农业建设模式。基本形成布局合理的有福建特色的现代生态农业建设体系。
（八）农田基本建设工程
继续抓好大型灌区续建配套与节水改造、万亩旱片整治、节水灌溉、中低产田改造等工程的建设。“十五”期间，继续建设山美、东张、东圳、峰头、北引等大型灌区续建配套与节水改造工程，抓好上杭南阳、诏安四都、武平象洞、福安甘棠等80个重点旱片治理工程；结合农业综合开发、冬春水利建设，改造中低产田300万亩；建设20个节水示范县、30个节水示范项目。以治水改土增肥为重点，采取用养结合、综合治理的方针，全面实施“沃土计划”，改良培育地力，努力提高地力等级。
（九）农村新能源建设工程
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